66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4711 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  79.93 
 
 		 550 aa  919    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  65.93 
 
 		 543 aa  757    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  100 
 
 		 547 aa  1138    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  73.95 
 
 		 595 aa  823    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  47.11 
 
 		 680 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  51.34 
 
 		 706 aa  498  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  45.14 
 
 		 668 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  41.6 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  39.77 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1261  xanthan lyase protein  34.02 
 
 		 592 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  23.82 
 
 		 585 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  22.16 
 
 		 599 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  22.45 
 
 		 584 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  22.45 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.77 
 
 		 582 aa  78.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  23.55 
 
 		 595 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  23.8 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  22.53 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  23.04 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  30.28 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.47 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  28.72 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30.34 
 
 		 606 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  28.12 
 
 		 448 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 423 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  30.5 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  23.21 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  30.13 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  23.01 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.45 
 
 		 445 aa  57  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  30.2 
 
 		 784 aa  57.4  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 537 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  32.88 
 
 		 445 aa  54.7  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  28.95 
 
 		 457 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.73 
 
 		 540 aa  54.3  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  23.46 
 
 		 595 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.08 
 
 		 672 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  26.76 
 
 		 491 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  24.38 
 
 		 595 aa  52  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  27.1 
 
 		 595 aa  50.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.57 
 
 		 722 aa  50.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  28.66 
 
 		 532 aa  50.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  29.13 
 
 		 618 aa  50.4  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  29.27 
 
 		 624 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 475 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  21.77 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  30.08 
 
 		 600 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  29.85 
 
 		 764 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  24.6 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  32 
 
 		 797 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.71 
 
 		 641 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  27.45 
 
 		 531 aa  47.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 483 aa  47.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  24.19 
 
 		 483 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  26.9 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  21.74 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 		 534 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  27.46 
 
 		 748 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.9 
 
 		 461 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  33.33 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 443 aa  43.5  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>