133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0457 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  956    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.13 
 
 		 472 aa  289  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  38.34 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 		 423 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  37.56 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  37.7 
 
 		 448 aa  256  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  34.94 
 
 		 459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  36.81 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  37.01 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  33.84 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  33.7 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 454 aa  213  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  38.03 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  31.96 
 
 		 431 aa  203  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  32.25 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  32.17 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.99 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  31.95 
 
 		 445 aa  193  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  33.98 
 
 		 457 aa  192  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  32.57 
 
 		 491 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 445 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  33.91 
 
 		 456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  33.55 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 468 aa  176  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  31.45 
 
 		 600 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  33.11 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  30.05 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  29.94 
 
 		 672 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  27.11 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30.24 
 
 		 606 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  29.8 
 
 		 483 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 421 aa  130  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 433 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  28.61 
 
 		 618 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  30.34 
 
 		 437 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  27.81 
 
 		 764 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  27.12 
 
 		 757 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  27.68 
 
 		 797 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  27.44 
 
 		 531 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  27.48 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 483 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  41.84 
 
 		 748 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.68 
 
 		 722 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.23 
 
 		 641 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  26.43 
 
 		 764 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  25.11 
 
 		 758 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  35.19 
 
 		 582 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.8 
 
 		 600 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  35.11 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  25.42 
 
 		 761 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  30.05 
 
 		 599 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  24.7 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  25.32 
 
 		 784 aa  73.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  31.08 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.24 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  26.55 
 
 		 595 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  31.52 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  31.1 
 
 		 601 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  34.27 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.14 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  31.78 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  28.57 
 
 		 595 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  34.46 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  35.85 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  27.82 
 
 		 568 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  32.92 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  34.91 
 
 		 696 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  31.67 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  31.58 
 
 		 595 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  30 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  31.53 
 
 		 669 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  32.39 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  30.5 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  31.72 
 
 		 621 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  38.46 
 
 		 675 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 676 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  32.62 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  28.87 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  26.54 
 
 		 532 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  31.53 
 
 		 660 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  28.99 
 
 		 543 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  22.33 
 
 		 534 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  29.8 
 
 		 595 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>