150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2126 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  100 
 
 		 459 aa  937    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  76.11 
 
 		 453 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  34.94 
 
 		 466 aa  256  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  38.11 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.39 
 
 		 472 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  33.56 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  37.33 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 457 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  34.93 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 457 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  32.98 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 446 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  32.64 
 
 		 456 aa  203  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  31.63 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  31.58 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  37.42 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  35.39 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  28.29 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  34.82 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  34.76 
 
 		 465 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  28.1 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  34.35 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.35 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.87 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  28.22 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 455 aa  146  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 468 aa  146  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  28.48 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  28.02 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  27.89 
 
 		 624 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.35 
 
 		 600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  27.78 
 
 		 672 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  25.27 
 
 		 618 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.88 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  31.41 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.62 
 
 		 641 aa  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  28.72 
 
 		 784 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  25.41 
 
 		 531 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.24 
 
 		 600 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  23.49 
 
 		 764 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  23.97 
 
 		 757 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  24.71 
 
 		 680 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  36.84 
 
 		 748 aa  79.7  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  23.06 
 
 		 758 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  25.55 
 
 		 797 aa  73.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.59 
 
 		 722 aa  70.5  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  21.53 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  20.79 
 
 		 625 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  25.88 
 
 		 549 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  23.79 
 
 		 763 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.68 
 
 		 582 aa  63.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  23.39 
 
 		 619 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  23.97 
 
 		 761 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  25.05 
 
 		 599 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  25.26 
 
 		 601 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6387  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.28 
 
 		 565 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3104  hypothetical protein  31.34 
 
 		 558 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0369  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 567 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.33 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  28.48 
 
 		 706 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4965  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.8 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.07 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3567  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  47.37 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.593485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  19.69 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1469  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.82 
 
 		 556 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0649357  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6359  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.82 
 
 		 556 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  29.77 
 
 		 549 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.28 
 
 		 415 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1190  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.07 
 
 		 560 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  unclonable  0.0000120152 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.82 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  35.29 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  26.55 
 
 		 531 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  26.6 
 
 		 621 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.45 
 
 		 467 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  36.7 
 
 		 512 aa  47  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1531  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  52.63 
 
 		 409 aa  47  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0966  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.29 
 
 		 351 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.289522  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  35.44 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  57.58 
 
 		 543 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  64.52 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 521 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>