79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3567 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  100 
 
 		 514 aa  1072    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  43.82 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 		 534 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  41.8 
 
 		 532 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  41.68 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  40.87 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  42.8 
 
 		 537 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  43.14 
 
 		 527 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.09 
 
 		 540 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  42.03 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 		 538 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  40.54 
 
 		 619 aa  362  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  39.68 
 
 		 531 aa  360  5e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  39.69 
 
 		 530 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  39.84 
 
 		 621 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  25.54 
 
 		 660 aa  140  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 676 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  24.26 
 
 		 679 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  24.32 
 
 		 669 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  23.39 
 
 		 692 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  24.11 
 
 		 679 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  24.04 
 
 		 675 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  26.42 
 
 		 582 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  28.32 
 
 		 584 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 		 661 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  28.13 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  25.1 
 
 		 599 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  22.95 
 
 		 691 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  23.53 
 
 		 696 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.2 
 
 		 595 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  23.19 
 
 		 696 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  24.13 
 
 		 595 aa  93.2  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  23.52 
 
 		 435 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  23.58 
 
 		 595 aa  87.4  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  23.67 
 
 		 531 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  23.98 
 
 		 585 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30.95 
 
 		 624 aa  80.1  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  23.06 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  23.09 
 
 		 601 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  22.47 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  23.73 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  23.42 
 
 		 680 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  29.45 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.51 
 
 		 600 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  24.31 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  23.44 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  21.18 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  22.72 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  20.94 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  21.31 
 
 		 672 aa  63.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  29.58 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  22.54 
 
 		 595 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.21 
 
 		 722 aa  60.1  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  23.37 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  27.86 
 
 		 748 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  32.39 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  28.17 
 
 		 764 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 475 aa  57  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  28.23 
 
 		 761 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  26.5 
 
 		 757 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  28.79 
 
 		 797 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  26.83 
 
 		 784 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  29.2 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  27.69 
 
 		 764 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.42 
 
 		 618 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  21.34 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  27.49 
 
 		 763 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  21.52 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.06 
 
 		 758 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  28.12 
 
 		 668 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  25.53 
 
 		 432 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  24.48 
 
 		 448 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2205  enoate reductase, putative  29.63 
 
 		 726 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241154  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  27.69 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1971  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.59 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2156  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  41.18 
 
 		 667 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  22.29 
 
 		 456 aa  43.5  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>