More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1971 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1971  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
449 aa  905    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.12 
 
 
470 aa  263  4.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.02 
 
 
470 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.07 
 
 
468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.37 
 
 
585 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
472 aa  250  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.11 
 
 
470 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
484 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
459 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
484 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
484 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.67 
 
 
462 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
475 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1402  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.92 
 
 
443 aa  246  4e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0133365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.38 
 
 
616 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.22 
 
 
481 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
468 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
468 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
463 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.85 
 
 
581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.13 
 
 
492 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.11 
 
 
470 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
680 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.2 
 
 
491 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  33.71 
 
 
546 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 
473 aa  236  8e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.85 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.79 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.45 
 
 
463 aa  233  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
619 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
625 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.34 
 
 
478 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
467 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.11 
 
 
464 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.53 
 
 
476 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
593 aa  230  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.12 
 
 
478 aa  230  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
599 aa  230  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
464 aa  230  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.26 
 
 
478 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  32.51 
 
 
546 aa  229  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  32.51 
 
 
546 aa  229  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.31 
 
 
465 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  31.13 
 
 
478 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.15 
 
 
467 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
478 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
469 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
478 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
475 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.01 
 
 
475 aa  226  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.86 
 
 
480 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.89 
 
 
476 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
458 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.73 
 
 
462 aa  226  9e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.59 
 
 
477 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
474 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
475 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
474 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.18 
 
 
469 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 
476 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.78 
 
 
474 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
474 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
474 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.53 
 
 
473 aa  224  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.72 
 
 
467 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
478 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
478 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
594 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.39 
 
 
496 aa  224  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 
476 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.76 
 
 
459 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.67 
 
 
480 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
562 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
478 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  31.92 
 
 
462 aa  223  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
478 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  31 
 
 
462 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.54 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.39 
 
 
475 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.6 
 
 
474 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
478 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.1 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>