61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1485 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  59.94 
 
 
691 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  52.31 
 
 
661 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  58.28 
 
 
669 aa  737    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  60.97 
 
 
679 aa  803    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  59.17 
 
 
696 aa  813    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  60.97 
 
 
679 aa  803    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  59.02 
 
 
696 aa  812    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  100 
 
 
675 aa  1409    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  55.42 
 
 
660 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  59.42 
 
 
676 aa  806    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  57.4 
 
 
692 aa  777    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  28.14 
 
 
619 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  26.92 
 
 
621 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  24.2 
 
 
514 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  25.56 
 
 
595 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  24.57 
 
 
549 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  26.5 
 
 
568 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
538 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  24.23 
 
 
532 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  25.85 
 
 
531 aa  125  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  24.92 
 
 
530 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  26.08 
 
 
532 aa  124  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.58 
 
 
540 aa  120  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  24.25 
 
 
527 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 
534 aa  117  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 
537 aa  109  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  24.59 
 
 
595 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.14 
 
 
584 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.07 
 
 
582 aa  71.2  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  38.46 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  24.14 
 
 
584 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  23.5 
 
 
599 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  45 
 
 
435 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  22.58 
 
 
595 aa  62  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  24.53 
 
 
585 aa  61.6  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  35.71 
 
 
624 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
526 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  34.23 
 
 
641 aa  55.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  35.78 
 
 
797 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
475 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  30.28 
 
 
748 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  41.67 
 
 
444 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  33.03 
 
 
445 aa  52.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  34.94 
 
 
672 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  31.07 
 
 
606 aa  51.2  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  23.89 
 
 
601 aa  50.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  25.68 
 
 
618 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
457 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  29.55 
 
 
764 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.66 
 
 
600 aa  47.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  34.57 
 
 
491 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
453 aa  46.6  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.48 
 
 
459 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.65 
 
 
472 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
464 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  28.97 
 
 
758 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  40 
 
 
454 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
460 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.4 
 
 
722 aa  44.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  40.82 
 
 
472 aa  44.3  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
423 aa  43.9  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>