56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0190 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  60.91 
 
 
692 aa  834    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 
676 aa  856    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  55.69 
 
 
696 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  62.96 
 
 
679 aa  845    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  54.42 
 
 
661 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  63.16 
 
 
691 aa  805    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  58.28 
 
 
675 aa  761    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  55.67 
 
 
696 aa  739    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  62.8 
 
 
679 aa  843    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  100 
 
 
669 aa  1388    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  56.71 
 
 
660 aa  691    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  27.87 
 
 
619 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  26.51 
 
 
549 aa  148  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  27.52 
 
 
531 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  25.71 
 
 
595 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 
534 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  25.2 
 
 
532 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  24.88 
 
 
514 aa  140  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  25.33 
 
 
532 aa  136  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  25.25 
 
 
568 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  25.16 
 
 
527 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 
537 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.94 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  24.19 
 
 
530 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 
538 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  27.78 
 
 
621 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  24.92 
 
 
595 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.92 
 
 
584 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  24.32 
 
 
599 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  24.38 
 
 
584 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  25.19 
 
 
582 aa  66.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  21.8 
 
 
595 aa  61.2  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  28.15 
 
 
748 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  31.53 
 
 
466 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  24.74 
 
 
585 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  40.62 
 
 
435 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  26.19 
 
 
624 aa  56.2  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  23.23 
 
 
595 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.19 
 
 
641 aa  50.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  29.29 
 
 
757 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
475 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  25.2 
 
 
758 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  28.24 
 
 
764 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  31.68 
 
 
491 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  26.53 
 
 
600 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.3 
 
 
606 aa  48.1  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  22.76 
 
 
601 aa  47.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
423 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  29.55 
 
 
797 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  31.76 
 
 
672 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  27.03 
 
 
431 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 
457 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.78 
 
 
642 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  37.5 
 
 
454 aa  43.9  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  44.64 
 
 
448 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 
526 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>