69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1299 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  100 
 
 
549 aa  1097    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  61.34 
 
 
532 aa  598  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  55.45 
 
 
532 aa  550  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  55.6 
 
 
527 aa  546  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  55.2 
 
 
531 aa  508  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.02 
 
 
540 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  48.22 
 
 
595 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  51.46 
 
 
538 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  49.34 
 
 
568 aa  475  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  53.41 
 
 
537 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  48.04 
 
 
534 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  50 
 
 
530 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  42.64 
 
 
514 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  48.37 
 
 
619 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  47.91 
 
 
621 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
676 aa  156  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  28.02 
 
 
692 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  27.05 
 
 
669 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  26.95 
 
 
679 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  25.56 
 
 
675 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  26.8 
 
 
679 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  29.28 
 
 
582 aa  133  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  27.12 
 
 
660 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
661 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  25.96 
 
 
696 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  25.96 
 
 
696 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  27.81 
 
 
691 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  29.9 
 
 
595 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  28.14 
 
 
599 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  30.52 
 
 
585 aa  100  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  27.21 
 
 
584 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  27.34 
 
 
584 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  26.25 
 
 
595 aa  88.2  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  24.19 
 
 
531 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  25.43 
 
 
624 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  30.63 
 
 
601 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  25.35 
 
 
595 aa  67  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
475 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  22.61 
 
 
680 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.62 
 
 
600 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  33.33 
 
 
748 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  27.23 
 
 
672 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  29.38 
 
 
549 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  32.62 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  29.59 
 
 
606 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  28.06 
 
 
668 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
423 aa  54.3  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.8 
 
 
641 aa  53.9  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
453 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.2 
 
 
472 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  24.88 
 
 
543 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  23.68 
 
 
595 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  28.91 
 
 
457 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  22.75 
 
 
456 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  31.75 
 
 
764 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  24.83 
 
 
618 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  23.54 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.77 
 
 
459 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  24.8 
 
 
432 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.52 
 
 
600 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  23.99 
 
 
491 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  24.21 
 
 
706 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1770  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.89 
 
 
666 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  28.65 
 
 
784 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.05 
 
 
435 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  20.69 
 
 
431 aa  45.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.92 
 
 
667 aa  43.5  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.107762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>