72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3972 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1238    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  70.75 
 
 
568 aa  819    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  52.92 
 
 
527 aa  548  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  53.9 
 
 
537 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  52.75 
 
 
532 aa  543  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  51.89 
 
 
532 aa  528  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.25 
 
 
540 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  49.9 
 
 
538 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  51.64 
 
 
530 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  49.44 
 
 
531 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  48.22 
 
 
549 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  45.92 
 
 
534 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  46.21 
 
 
619 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  40.91 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  44.73 
 
 
621 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  26.17 
 
 
692 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  25.38 
 
 
660 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  27.19 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  27.19 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
676 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  25.53 
 
 
675 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 
661 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  25.4 
 
 
669 aa  136  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  25.56 
 
 
696 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  25 
 
 
696 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  24.92 
 
 
691 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  27.4 
 
 
584 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  25.91 
 
 
582 aa  93.2  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  26.69 
 
 
595 aa  93.2  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  27.06 
 
 
584 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  26.6 
 
 
601 aa  87.4  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  25.74 
 
 
599 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  26.79 
 
 
585 aa  81.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.49 
 
 
595 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  23.65 
 
 
624 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  23.35 
 
 
543 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  30.5 
 
 
757 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  23.42 
 
 
531 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  22.75 
 
 
595 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  29.41 
 
 
600 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  28.57 
 
 
466 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  23.99 
 
 
549 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  21.85 
 
 
680 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  31.58 
 
 
606 aa  62  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  21.64 
 
 
491 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  31.01 
 
 
748 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  30.19 
 
 
435 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
600 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
475 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  29.45 
 
 
595 aa  58.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  25.25 
 
 
764 aa  57.4  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  24.46 
 
 
431 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  23.4 
 
 
547 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.36 
 
 
641 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  21.92 
 
 
706 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  27.14 
 
 
797 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  24.67 
 
 
457 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  25.31 
 
 
758 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  20.11 
 
 
672 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  25.57 
 
 
761 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1770  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38 
 
 
666 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  22.91 
 
 
459 aa  48.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  24.72 
 
 
421 aa  47.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  21.38 
 
 
668 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  26.85 
 
 
454 aa  47  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  22.54 
 
 
448 aa  47.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  26.57 
 
 
764 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
464 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.36 
 
 
722 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.69 
 
 
472 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  21.92 
 
 
618 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  35.23 
 
 
507 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>