109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3542 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.19 
 
 
722 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  56.82 
 
 
797 aa  858    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  60.61 
 
 
757 aa  964    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  55.2 
 
 
764 aa  885    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  100 
 
 
758 aa  1584    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  65.71 
 
 
764 aa  1057    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  37.84 
 
 
748 aa  445  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  37.06 
 
 
761 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  42.17 
 
 
641 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  32.52 
 
 
784 aa  310  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.34 
 
 
600 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  34.59 
 
 
763 aa  195  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.23 
 
 
435 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  25.17 
 
 
431 aa  111  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  28.87 
 
 
448 aa  101  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
464 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
423 aa  94  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  25 
 
 
466 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  24.42 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  34.62 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  24.29 
 
 
672 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  31.58 
 
 
606 aa  77  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.61 
 
 
472 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  34.93 
 
 
582 aa  75.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  29.05 
 
 
624 aa  74.7  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 
414 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  24.66 
 
 
619 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  38.3 
 
 
445 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  33.97 
 
 
599 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  35.62 
 
 
531 aa  70.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  34.85 
 
 
432 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  25.4 
 
 
584 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.9 
 
 
584 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  26.33 
 
 
621 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.34 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  34.21 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.05 
 
 
595 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 
457 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  29.79 
 
 
600 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  25 
 
 
421 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
441 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  23.62 
 
 
454 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
457 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  35.79 
 
 
478 aa  61.6  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
451 aa  61.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
453 aa  60.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  30.53 
 
 
440 aa  60.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.16 
 
 
461 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
441 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
411 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.01 
 
 
618 aa  58.9  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 
445 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  37.38 
 
 
444 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  23.3 
 
 
595 aa  57  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
454 aa  57  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  26.73 
 
 
410 aa  57  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  24.6 
 
 
549 aa  56.6  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  33.64 
 
 
465 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
433 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  30.66 
 
 
445 aa  55.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  27.88 
 
 
483 aa  54.7  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 
457 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
676 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
537 aa  53.5  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  27.21 
 
 
530 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  27.27 
 
 
668 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  25.05 
 
 
585 aa  51.2  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
460 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  25.31 
 
 
595 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  27.78 
 
 
527 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  25.2 
 
 
669 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  27.27 
 
 
691 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  28.78 
 
 
680 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  27.19 
 
 
457 aa  48.9  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5071  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  57.89 
 
 
453 aa  48.5  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  26.06 
 
 
514 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
538 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  27.21 
 
 
595 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5492  putative succinate dehydrogenase  46.81 
 
 
567 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3104  hypothetical protein  26.5 
 
 
558 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  43.86 
 
 
598 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0671  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 
468 aa  46.6  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  35.35 
 
 
596 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  26.86 
 
 
706 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.71 
 
 
519 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
468 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.4 
 
 
540 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  25.68 
 
 
531 aa  45.8  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  31.19 
 
 
456 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  29.82 
 
 
437 aa  46.2  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  40.35 
 
 
598 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  25.52 
 
 
543 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  29.91 
 
 
696 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  29.91 
 
 
696 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.72 
 
 
561 aa  45.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  35.14 
 
 
556 aa  45.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>