125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3110 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1381    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  46.37 
 
 		 600 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  42.77 
 
 		 624 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  41.45 
 
 		 606 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  32.59 
 
 		 618 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  29.71 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  23.37 
 
 		 625 aa  151  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.19 
 
 		 472 aa  146  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 464 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.31 
 
 		 435 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  28.28 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  28.9 
 
 		 448 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 423 aa  140  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 		 475 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  26.64 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  28.76 
 
 		 457 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  32.95 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  27.84 
 
 		 445 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.78 
 
 		 459 aa  114  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 453 aa  114  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  27.5 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 468 aa  112  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 421 aa  106  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  26.13 
 
 		 445 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.77 
 
 		 461 aa  102  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  27.94 
 
 		 457 aa  100  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 454 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  25.34 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  28.4 
 
 		 465 aa  97.4  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  36.99 
 
 		 491 aa  97.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  35.2 
 
 		 421 aa  97.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  25.55 
 
 		 764 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  24.25 
 
 		 459 aa  96.3  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 460 aa  95.5  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  26.19 
 
 		 582 aa  92.8  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  26.25 
 
 		 584 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 457 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.95 
 
 		 722 aa  88.6  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  24.29 
 
 		 758 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 462 aa  87.4  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 443 aa  86.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 		 451 aa  87  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  26.2 
 
 		 584 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  34.88 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 483 aa  80.1  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  33.9 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  39.33 
 
 		 437 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2103  hypothetical protein  24.85 
 
 		 583 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.469533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  21.31 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  24.71 
 
 		 599 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  34.33 
 
 		 748 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 460 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.31 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  23.63 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.24 
 
 		 595 aa  67.8  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  36.96 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  23.96 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  24.75 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  32.21 
 
 		 543 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 433 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  28.48 
 
 		 757 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  27.23 
 
 		 549 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  25.58 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  23.75 
 
 		 530 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3104  hypothetical protein  23.32 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  29.56 
 
 		 531 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  32.69 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  25.37 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  29.93 
 
 		 595 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  35.33 
 
 		 549 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 537 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  31.51 
 
 		 680 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  30.2 
 
 		 595 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  35.48 
 
 		 761 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.29 
 
 		 600 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 676 aa  54.3  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  30.07 
 
 		 532 aa  53.9  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  31.34 
 
 		 660 aa  53.9  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  24.32 
 
 		 585 aa  53.9  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  23.08 
 
 		 668 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  30.14 
 
 		 706 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  28.08 
 
 		 547 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  30.56 
 
 		 764 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  26.67 
 
 		 763 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  23.75 
 
 		 532 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  20.11 
 
 		 595 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  22.73 
 
 		 568 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  34.94 
 
 		 696 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  34.94 
 
 		 696 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>