74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1335 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  62.25 
 
 
595 aa  749    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1209    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  53.79 
 
 
601 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  41.47 
 
 
584 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  41.47 
 
 
584 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  42.5 
 
 
585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  39.58 
 
 
599 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  39.12 
 
 
595 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  37.21 
 
 
582 aa  368  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  28.74 
 
 
619 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  24.43 
 
 
514 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  28.04 
 
 
621 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
534 aa  94  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  28.69 
 
 
784 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  26.45 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  26.14 
 
 
527 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.49 
 
 
540 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  24.59 
 
 
532 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  20.37 
 
 
706 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  22.66 
 
 
531 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
537 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  25.23 
 
 
761 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  22.32 
 
 
692 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  22.8 
 
 
549 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  25.5 
 
 
531 aa  70.1  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  22.93 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.35 
 
 
641 aa  68.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  25.35 
 
 
549 aa  67  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  19.78 
 
 
543 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  20.83 
 
 
676 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  21.9 
 
 
675 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  22.05 
 
 
606 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
538 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  26.44 
 
 
680 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  26.94 
 
 
550 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  23.63 
 
 
435 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  22.22 
 
 
600 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  29.45 
 
 
595 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.46 
 
 
472 aa  57.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 
423 aa  58.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  24.15 
 
 
764 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  30.2 
 
 
672 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  29.37 
 
 
568 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 
661 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  21.74 
 
 
457 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  22.4 
 
 
679 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  22.4 
 
 
679 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  22.6 
 
 
660 aa  54.3  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  23.4 
 
 
748 aa  53.9  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  23.19 
 
 
763 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  21.9 
 
 
445 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  30.92 
 
 
532 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  22.86 
 
 
691 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  27.96 
 
 
491 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  27.16 
 
 
483 aa  51.2  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  25.48 
 
 
547 aa  50.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  28.26 
 
 
669 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  26.14 
 
 
764 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  20.68 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  22.18 
 
 
757 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
475 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.65 
 
 
722 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  26.74 
 
 
668 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.94 
 
 
600 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  23.68 
 
 
624 aa  47.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  23.83 
 
 
595 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  25.97 
 
 
448 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
466 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
466 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  22.97 
 
 
431 aa  44.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 
466 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  24.88 
 
 
758 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  27.13 
 
 
797 aa  43.9  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>