126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0569 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  100 
 
 		 445 aa  892    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  37.56 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  37.81 
 
 		 453 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  39.21 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  36.54 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.86 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  32.59 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  31.61 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 451 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  33.87 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  35.66 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  36.6 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  29.89 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  31.62 
 
 		 448 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  31.74 
 
 		 465 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 457 aa  169  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  27.06 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  30.09 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  33.18 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.41 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 441 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  29.09 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 411 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  27.21 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  27.63 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  27.87 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  30.63 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  27.48 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  32.95 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  26.08 
 
 		 600 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  27.8 
 
 		 672 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30.5 
 
 		 624 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  27.25 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  23.58 
 
 		 618 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  24.18 
 
 		 531 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  27.71 
 
 		 797 aa  86.7  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  27.68 
 
 		 761 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  24.78 
 
 		 757 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.9 
 
 		 722 aa  84.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  24.05 
 
 		 764 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  29.29 
 
 		 748 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  21.69 
 
 		 625 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  24.41 
 
 		 764 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.55 
 
 		 641 aa  73.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  22.7 
 
 		 758 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  27.74 
 
 		 763 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.57 
 
 		 600 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  27.81 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  27.59 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  26.76 
 
 		 543 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  27.45 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  29.86 
 
 		 549 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  33.99 
 
 		 784 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  27.68 
 
 		 621 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  27.86 
 
 		 619 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  25.87 
 
 		 680 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  24.35 
 
 		 599 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  66.67 
 
 		 560 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  66.67 
 
 		 563 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  66.67 
 
 		 563 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  66.67 
 
 		 570 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  57.5 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  62.5 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  64.29 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  24.84 
 
 		 595 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  66.67 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  43.55 
 
 		 584 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.08 
 
 		 584 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  24.49 
 
 		 584 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0671  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.33 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  61.54 
 
 		 514 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  26.21 
 
 		 668 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  57.5 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.97 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6317  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.54 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  31.28 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.89 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  50.91 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0071  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.82 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0824  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  31.33 
 
 		 624 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>