46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2922 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  100 
 
 
625 aa  1266    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  24.65 
 
 
606 aa  177  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  26.27 
 
 
618 aa  177  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  26.02 
 
 
600 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  24.81 
 
 
624 aa  152  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  23.37 
 
 
672 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  25.88 
 
 
448 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  21.39 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.34 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  24.7 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  24.09 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  23.31 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  22.03 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  23.95 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  20.79 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 
457 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  24.68 
 
 
457 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.5 
 
 
472 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  19.75 
 
 
454 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  22.11 
 
 
464 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  21.6 
 
 
431 aa  60.1  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 
475 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  22.31 
 
 
483 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 
454 aa  55.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  20.37 
 
 
432 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  18.98 
 
 
455 aa  53.9  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  18.97 
 
 
465 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  19.38 
 
 
457 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  24.77 
 
 
491 aa  50.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  21.85 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  23.41 
 
 
457 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  34.18 
 
 
660 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  23.56 
 
 
595 aa  48.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  25.6 
 
 
680 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  26.59 
 
 
668 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
676 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  26.5 
 
 
748 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  22.09 
 
 
549 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
460 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 
441 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  18.94 
 
 
433 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  25.26 
 
 
530 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 
443 aa  43.9  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>