81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3215 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 483 aa  978    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 455 aa  197  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.05 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.48 
 
 		 472 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  29.17 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  28.66 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.99 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  26.54 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  27.91 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.09 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  29.39 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.11 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  25.11 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  25.38 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  29.81 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.19 
 
 		 672 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  28.2 
 
 		 624 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  32.33 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  28.8 
 
 		 457 aa  109  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.53 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.09 
 
 		 606 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 445 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  26.47 
 
 		 600 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 446 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  25.95 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  22.37 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  25.24 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  22.69 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  24.59 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  24.92 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  44.59 
 
 		 584 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  46.58 
 
 		 599 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  44.59 
 
 		 584 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  21.43 
 
 		 618 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  43.24 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  23.95 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  26.84 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  41.57 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  25.71 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  37.08 
 
 		 621 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  41.27 
 
 		 530 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  43.24 
 
 		 1000 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  46.58 
 
 		 595 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  48.28 
 
 		 492 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 647 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 534 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3262  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.25 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  47.46 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  19.42 
 
 		 625 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.5 
 
 		 641 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3855  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  48.21 
 
 		 672 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  36.63 
 
 		 487 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  36.63 
 
 		 487 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 537 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  46.55 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  29.27 
 
 		 595 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  34.67 
 
 		 532 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  21.29 
 
 		 514 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  44.07 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  44.07 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  23.56 
 
 		 758 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  54.35 
 
 		 976 aa  43.9  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  48 
 
 		 488 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  48 
 
 		 487 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>