115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5110 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 454 aa  924    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  75.06 
 
 		 443 aa  626  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  53.23 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  38.26 
 
 		 459 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 464 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 423 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.09 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  37.32 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  36.09 
 
 		 466 aa  239  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  39.32 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  35.68 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  39.15 
 
 		 475 aa  213  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  33.84 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  38.09 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  32.89 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  37.78 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 457 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  30.91 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 421 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  31.54 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  33.68 
 
 		 491 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  32.1 
 
 		 457 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  32.44 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 455 aa  163  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  31.3 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  25.73 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  32.97 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.29 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  28.47 
 
 		 600 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  31.07 
 
 		 606 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  31.57 
 
 		 483 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  29.37 
 
 		 421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  31.04 
 
 		 624 aa  137  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  27.96 
 
 		 672 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 441 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  31.99 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  23.58 
 
 		 618 aa  93.6  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  27 
 
 		 764 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.64 
 
 		 758 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.8 
 
 		 641 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  25.83 
 
 		 764 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  26.97 
 
 		 757 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.78 
 
 		 722 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  26.59 
 
 		 797 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.12 
 
 		 600 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  27.44 
 
 		 748 aa  79.7  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  28.47 
 
 		 761 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.84 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  26.17 
 
 		 763 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  32 
 
 		 531 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  27.19 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  23.43 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  27.62 
 
 		 680 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  23.85 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  24.21 
 
 		 599 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  29.29 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  22.27 
 
 		 625 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  29.37 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  29.95 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  31.82 
 
 		 619 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  22.56 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0638  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  58.54 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  29.22 
 
 		 621 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  28.37 
 
 		 531 aa  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  26.21 
 
 		 706 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  29.6 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  35.48 
 
 		 669 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  37.36 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7441  putative FAD-binding dehydrogenase  47.27 
 
 		 598 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1531  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.79 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  27.08 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  26.44 
 
 		 668 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  28.33 
 
 		 549 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  30.22 
 
 		 595 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  48.08 
 
 		 685 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.02 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  25.71 
 
 		 595 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  45.61 
 
 		 1000 aa  47  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0966  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.86 
 
 		 351 aa  47  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.289522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  59.52 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  25.68 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.24 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  27.64 
 
 		 532 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>