77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4710 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  58.3 
 
 		 668 aa  793    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  100 
 
 		 680 aa  1410    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  45.8 
 
 		 550 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  43 
 
 		 706 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  47.11 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  46.27 
 
 		 543 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  46.97 
 
 		 595 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  42.86 
 
 		 549 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  39.65 
 
 		 531 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1261  xanthan lyase protein  36.2 
 
 		 592 aa  271  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  24.75 
 
 		 435 aa  87.8  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  23.65 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  35.51 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.31 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  30.41 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  22.85 
 
 		 532 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  23.42 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  34.51 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 534 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  27.68 
 
 		 595 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.74 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  20.62 
 
 		 527 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 423 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  21.82 
 
 		 619 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.9 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  27.44 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  28.92 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  27.44 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  21.83 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  21.77 
 
 		 585 aa  57  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  29.89 
 
 		 600 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  26.4 
 
 		 606 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  31.25 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  21.15 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  28.67 
 
 		 582 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  31.51 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30.61 
 
 		 624 aa  55.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  22.59 
 
 		 621 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 443 aa  53.9  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  21 
 
 		 595 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  26.17 
 
 		 532 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  26.26 
 
 		 797 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  25.87 
 
 		 445 aa  52  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  25.99 
 
 		 448 aa  52  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  21.7 
 
 		 763 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.7 
 
 		 600 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  28.78 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  28.7 
 
 		 478 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  21.61 
 
 		 549 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  26.23 
 
 		 748 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  29.05 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  22.55 
 
 		 568 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  26.01 
 
 		 431 aa  48.5  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  31.49 
 
 		 444 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  28.95 
 
 		 717 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  27.61 
 
 		 784 aa  48.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  30 
 
 		 457 aa  47.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  34.52 
 
 		 599 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 457 aa  47.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 441 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.72 
 
 		 540 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.26 
 
 		 641 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 451 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 457 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.22 
 
 		 722 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  28.06 
 
 		 432 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  29.31 
 
 		 764 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  26.35 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  23.57 
 
 		 595 aa  45.8  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  29.59 
 
 		 757 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 454 aa  43.9  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  23.49 
 
 		 437 aa  43.9  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>