65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0108 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 668 aa  1389    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  58.3 
 
 		 680 aa  821    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  43.36 
 
 		 706 aa  487  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  45.77 
 
 		 550 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  46.65 
 
 		 595 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  45.14 
 
 		 547 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  45.47 
 
 		 543 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  37.48 
 
 		 531 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  38.97 
 
 		 549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1261  xanthan lyase protein  34.59 
 
 		 592 aa  251  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  25.05 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  32.2 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  23.6 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  24.18 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  23.6 
 
 		 532 aa  73.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  31.34 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  22.46 
 
 		 530 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  22.62 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  22.81 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  27.33 
 
 		 606 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  23.23 
 
 		 621 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  21.11 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  25.43 
 
 		 595 aa  60.5  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  23.52 
 
 		 672 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  23.91 
 
 		 763 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  30.64 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  25.29 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.07 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  25.29 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  31.65 
 
 		 717 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 423 aa  55.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  28.74 
 
 		 448 aa  55.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  23.85 
 
 		 532 aa  54.7  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  28.22 
 
 		 466 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  28.35 
 
 		 514 aa  54.7  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  28.87 
 
 		 764 aa  53.9  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  28.22 
 
 		 784 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  19.8 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.76 
 
 		 472 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  31.62 
 
 		 391 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  27.27 
 
 		 758 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  21.73 
 
 		 531 aa  50.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28 
 
 		 540 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  29.7 
 
 		 568 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  26.99 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  27.43 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  31.37 
 
 		 797 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  29.65 
 
 		 454 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  28.43 
 
 		 757 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  33.09 
 
 		 676 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1123 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  24.85 
 
 		 445 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  21.38 
 
 		 595 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  25 
 
 		 618 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  26.21 
 
 		 445 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  24.05 
 
 		 764 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.83 
 
 		 722 aa  46.6  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3104  hypothetical protein  27.01 
 
 		 558 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  25.93 
 
 		 761 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4011  putative succinate dehydrogenase  34.78 
 
 		 587 aa  44.3  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  27.81 
 
 		 625 aa  43.9  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>