48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1699 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  72.81 
 
 		 595 aa  815    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  64.83 
 
 		 543 aa  747    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  79.93 
 
 		 547 aa  895    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  100 
 
 		 550 aa  1150    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  45.8 
 
 		 680 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  49.52 
 
 		 706 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  45.77 
 
 		 668 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  42.35 
 
 		 531 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  38.52 
 
 		 549 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1261  xanthan lyase protein  36.01 
 
 		 592 aa  282  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  23.97 
 
 		 582 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  23.26 
 
 		 585 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  22.57 
 
 		 599 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  23.44 
 
 		 514 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  22.71 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  22.99 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  23.35 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  31.77 
 
 		 448 aa  67  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  29.66 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  27.52 
 
 		 606 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  23.47 
 
 		 595 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  23.23 
 
 		 532 aa  53.9  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  28.95 
 
 		 784 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  26.13 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  33.56 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 534 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  25.48 
 
 		 595 aa  50.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 451 aa  50.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  25.35 
 
 		 432 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  27.78 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  21.76 
 
 		 619 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.07 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  26.35 
 
 		 445 aa  47.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  26.22 
 
 		 532 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  47.06 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  22.17 
 
 		 530 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  26.9 
 
 		 624 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  28.57 
 
 		 601 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.07 
 
 		 722 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  27.14 
 
 		 457 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 483 aa  43.9  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.88 
 
 		 540 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  26.32 
 
 		 672 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>