66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0194 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
534 aa  1078    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  53.9 
 
 
537 aa  495  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 
538 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  51.02 
 
 
532 aa  480  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  52.8 
 
 
532 aa  475  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  50.19 
 
 
527 aa  462  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  45.32 
 
 
595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  47.57 
 
 
540 aa  445  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  45.98 
 
 
568 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  45.72 
 
 
531 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  46.99 
 
 
549 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  41.76 
 
 
514 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  46.21 
 
 
530 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  45.57 
 
 
619 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  45.33 
 
 
621 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 
676 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  24.2 
 
 
692 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  25.62 
 
 
669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  28.46 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  25.23 
 
 
660 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  28.57 
 
 
599 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 
661 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  24.73 
 
 
679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  24.73 
 
 
679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  28.01 
 
 
595 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  23.66 
 
 
675 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  24.96 
 
 
696 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  24.65 
 
 
696 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  26.04 
 
 
584 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  26.38 
 
 
584 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  25.84 
 
 
595 aa  87  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  28.74 
 
 
585 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  22.5 
 
 
691 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  23.44 
 
 
531 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  24.9 
 
 
549 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  23.91 
 
 
595 aa  74.3  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  22.69 
 
 
680 aa  67  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  29.73 
 
 
624 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  32.72 
 
 
672 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  23.35 
 
 
668 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  20.47 
 
 
600 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  21.8 
 
 
543 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.5 
 
 
600 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.18 
 
 
606 aa  57  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  31.65 
 
 
748 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
475 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.27 
 
 
435 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  24.41 
 
 
550 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  28.95 
 
 
601 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  25.48 
 
 
757 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.37 
 
 
641 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  21.89 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  27.06 
 
 
764 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.69 
 
 
472 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  31.76 
 
 
784 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  27.54 
 
 
797 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  25.85 
 
 
764 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  25.11 
 
 
761 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.39 
 
 
758 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  26.87 
 
 
706 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 
436 aa  43.9  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  37.1 
 
 
392 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  45.65 
 
 
441 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
433 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>