78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3391 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1094    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  67.58 
 
 
527 aa  697    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  68.47 
 
 
531 aa  716    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  58.86 
 
 
532 aa  605  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  59.47 
 
 
537 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.62 
 
 
540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  55.69 
 
 
549 aa  548  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  53.58 
 
 
595 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  51.7 
 
 
568 aa  522  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  53.83 
 
 
538 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  51.02 
 
 
534 aa  508  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  53.03 
 
 
530 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  42.36 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  46.72 
 
 
619 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  44.88 
 
 
621 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 
676 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  26.75 
 
 
660 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  25.69 
 
 
669 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
661 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  25.53 
 
 
692 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  25.72 
 
 
675 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  26.41 
 
 
679 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  26.41 
 
 
679 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  25.5 
 
 
696 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  25.19 
 
 
696 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  25.74 
 
 
691 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  28.4 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  26.86 
 
 
584 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  26.96 
 
 
584 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  26.97 
 
 
599 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  26.88 
 
 
595 aa  90.1  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  27.89 
 
 
585 aa  87  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  25.96 
 
 
601 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  24.69 
 
 
595 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  25.55 
 
 
595 aa  77.8  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  22 
 
 
680 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.73 
 
 
600 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  24.03 
 
 
549 aa  67  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  23.93 
 
 
600 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  24.32 
 
 
550 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.32 
 
 
606 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  26.47 
 
 
624 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  22.81 
 
 
543 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  23.93 
 
 
668 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  36.11 
 
 
748 aa  57.4  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  26.54 
 
 
466 aa  57  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  28.57 
 
 
797 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  22.7 
 
 
531 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
475 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  21.24 
 
 
457 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  23.3 
 
 
454 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  23.22 
 
 
547 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  26.9 
 
 
757 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  26.06 
 
 
784 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  33.08 
 
 
706 aa  53.5  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  23.75 
 
 
672 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.36 
 
 
641 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.45 
 
 
435 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  27.74 
 
 
595 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.57 
 
 
472 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  26.47 
 
 
764 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  23.61 
 
 
618 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  25.48 
 
 
764 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  20.08 
 
 
431 aa  47  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.34 
 
 
722 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  23.81 
 
 
491 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1971  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.94 
 
 
449 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.26 
 
 
758 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.4 
 
 
459 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  28.5 
 
 
761 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
464 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
415 aa  44.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  29.41 
 
 
432 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.37 
 
 
976 aa  44.3  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  29.52 
 
 
456 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  42.86 
 
 
472 aa  43.9  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  47.62 
 
 
1000 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>