84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4983 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 538 aa  1090    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  63.08 
 
 		 537 aa  624  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.41 
 
 		 540 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  60.55 
 
 		 530 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  55.72 
 
 		 527 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 		 534 aa  522  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  53.5 
 
 		 532 aa  522  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  55.68 
 
 		 532 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  49.51 
 
 		 595 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  49.12 
 
 		 568 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  52.88 
 
 		 531 aa  491  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  51.46 
 
 		 549 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  46.63 
 
 		 619 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  46.15 
 
 		 621 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  41.05 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  28.22 
 
 		 660 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 661 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 676 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  25.81 
 
 		 675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  25.18 
 
 		 692 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  28.9 
 
 		 582 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  25.11 
 
 		 669 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  28.99 
 
 		 595 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  28.54 
 
 		 595 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  28.71 
 
 		 585 aa  97.8  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  24.75 
 
 		 679 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  24.75 
 
 		 679 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  29.45 
 
 		 599 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  26.2 
 
 		 624 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  25.65 
 
 		 584 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  25.79 
 
 		 584 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  30.19 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  29.81 
 
 		 696 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  26.16 
 
 		 601 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  35.17 
 
 		 691 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  21.31 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  23.49 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  23.65 
 
 		 668 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  30.41 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  29.52 
 
 		 595 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  24.24 
 
 		 706 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  25.46 
 
 		 454 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  34.38 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  22.77 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  27.36 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  24.59 
 
 		 672 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  29.17 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  28.86 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  24.34 
 
 		 491 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  29.63 
 
 		 600 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.14 
 
 		 641 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  29.22 
 
 		 606 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  23.04 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.65 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.67 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.63 
 
 		 722 aa  51.2  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  23.58 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.56 
 
 		 600 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  30.39 
 
 		 761 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  27.34 
 
 		 547 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  31.51 
 
 		 797 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  27.59 
 
 		 758 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  29.25 
 
 		 757 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  25.6 
 
 		 595 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  47.17 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  21.67 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  27.64 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  32 
 
 		 478 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  26.21 
 
 		 764 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  31.25 
 
 		 784 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  45.24 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  46.67 
 
 		 550 aa  44.3  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  29.13 
 
 		 451 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3567  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  32.95 
 
 		 476 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.593485  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 441 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  46.81 
 
 		 534 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50 
 
 		 561 aa  43.5  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  28 
 
 		 440 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 457 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>