76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0163 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  952    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  36.64 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.73 
 
 		 461 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  29.28 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  29.76 
 
 		 448 aa  156  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  26.92 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.49 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  26.82 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  24.94 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 475 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.48 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  27.71 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  27.09 
 
 		 491 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  24.35 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  24.89 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  26.1 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  25.29 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  29.69 
 
 		 465 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  24.15 
 
 		 456 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 421 aa  100  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  23.11 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  24.94 
 
 		 454 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.48 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  24.25 
 
 		 672 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  25.73 
 
 		 624 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  25.99 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  34.56 
 
 		 764 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  24.77 
 
 		 606 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  23.83 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  21.88 
 
 		 757 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  39.17 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  23.29 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  22.9 
 
 		 797 aa  70.1  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  32.23 
 
 		 748 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  33.6 
 
 		 763 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  34.21 
 
 		 758 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  21.85 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  30.09 
 
 		 764 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.28 
 
 		 600 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.58 
 
 		 722 aa  60.1  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  32.11 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  30.39 
 
 		 761 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  31.29 
 
 		 784 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  28.26 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  28.67 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.41 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 538 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  38.78 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5094  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  40.43 
 
 		 586 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0693824  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.76 
 
 		 540 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  53.66 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0582  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.88 
 
 		 503 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 537 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>