83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3383 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  75.56 
 
 		 540 aa  768    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1063    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  60.55 
 
 		 538 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  58.33 
 
 		 537 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  56.48 
 
 		 527 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  51.64 
 
 		 595 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  52.6 
 
 		 532 aa  495  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  50.49 
 
 		 568 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  52.13 
 
 		 531 aa  485  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  54.28 
 
 		 532 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  47.33 
 
 		 534 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  50.1 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  46.47 
 
 		 619 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  39.29 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  45.04 
 
 		 621 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  27.6 
 
 		 660 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  25.77 
 
 		 675 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 676 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 661 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  26.51 
 
 		 679 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  26.44 
 
 		 679 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  25.94 
 
 		 692 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  27.75 
 
 		 584 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  27.05 
 
 		 584 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  25.29 
 
 		 691 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  27.03 
 
 		 582 aa  106  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  24.02 
 
 		 696 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  24.18 
 
 		 696 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  26.89 
 
 		 595 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  25.46 
 
 		 599 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  27.76 
 
 		 585 aa  95.1  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  28.09 
 
 		 595 aa  95.1  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  26.35 
 
 		 595 aa  87.4  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  31.14 
 
 		 669 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  26.82 
 
 		 601 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  22.95 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  22.59 
 
 		 680 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  28.15 
 
 		 624 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  22.77 
 
 		 668 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  23.27 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  32.61 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 464 aa  67  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  34.38 
 
 		 748 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.03 
 
 		 600 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.17 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  23.52 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  23.89 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  23.75 
 
 		 672 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  30.3 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  29.23 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  29.13 
 
 		 784 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  23.78 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  28.57 
 
 		 595 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  21.86 
 
 		 600 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  22.95 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  22.22 
 
 		 457 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  30.41 
 
 		 706 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  29.45 
 
 		 757 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  27.75 
 
 		 764 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.47 
 
 		 641 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  27.21 
 
 		 758 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.8 
 
 		 722 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  21.75 
 
 		 550 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 423 aa  50.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  31.08 
 
 		 454 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  29.46 
 
 		 761 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  25.16 
 
 		 763 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  46.51 
 
 		 525 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  27.73 
 
 		 432 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  30.4 
 
 		 797 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  25.13 
 
 		 764 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  27.36 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  23.93 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  39.73 
 
 		 536 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.02 
 
 		 474 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  49.02 
 
 		 474 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0999  heterodisulfide reductase, subunit A (HdrA)  36.14 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  22.97 
 
 		 618 aa  44.3  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  28 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  33.66 
 
 		 478 aa  43.5  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>