84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2722 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  100 
 
 
532 aa  1060    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  58.89 
 
 
527 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  58.86 
 
 
532 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  61.51 
 
 
549 aa  598  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  55.6 
 
 
531 aa  549  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  57.17 
 
 
537 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  51.98 
 
 
595 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.76 
 
 
540 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  51.68 
 
 
568 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  54.51 
 
 
538 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  53.16 
 
 
534 aa  498  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  52.76 
 
 
530 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  48.03 
 
 
619 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  42.05 
 
 
514 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  47.02 
 
 
621 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
676 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  26.53 
 
 
692 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  27.9 
 
 
660 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  27.31 
 
 
679 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  27.31 
 
 
679 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
661 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  25.64 
 
 
669 aa  133  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  27.04 
 
 
675 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  26.34 
 
 
584 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  26.37 
 
 
584 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  24.64 
 
 
696 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  25 
 
 
691 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  29.61 
 
 
595 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  24.15 
 
 
696 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  28.01 
 
 
599 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  25.24 
 
 
531 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  23.67 
 
 
680 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  25.29 
 
 
624 aa  81.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  24.09 
 
 
668 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  36.08 
 
 
582 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  24.29 
 
 
549 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  25.29 
 
 
595 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  22.99 
 
 
543 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  30.77 
 
 
601 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  33.33 
 
 
748 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.07 
 
 
472 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  22.68 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.33 
 
 
641 aa  60.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  35.5 
 
 
585 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
475 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.51 
 
 
600 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  29.27 
 
 
595 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  31.97 
 
 
606 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 
423 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  30.07 
 
 
672 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  28.57 
 
 
706 aa  53.9  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.44 
 
 
435 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  30.07 
 
 
600 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  30.57 
 
 
595 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  26.07 
 
 
784 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  19.78 
 
 
445 aa  50.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  58.7 
 
 
464 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  28.66 
 
 
547 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  21.88 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  25.36 
 
 
491 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  28.43 
 
 
764 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  28.36 
 
 
757 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  26.5 
 
 
797 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1023  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.88 
 
 
685 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.38 
 
 
725 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  28.57 
 
 
454 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3199  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.51 
 
 
413 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.524731  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2127  heterodisulfide reductase, putative  43.4 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  27.84 
 
 
764 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.94 
 
 
557 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.15 
 
 
758 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0181  2,4-dienoyl-CoA reductase  41.38 
 
 
711 aa  45.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.126042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0638  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 
414 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1111  heterodisulfide reductase, putative  43.4 
 
 
412 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0204216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.61 
 
 
415 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1000  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  40.3 
 
 
778 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  47.5 
 
 
525 aa  44.3  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1648  heterodisulfide reductase, subunit A  50.98 
 
 
427 aa  43.9  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0282926  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.16 
 
 
643 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.11 
 
 
646 aa  43.9  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2894  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.51 
 
 
412 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  53.66 
 
 
456 aa  43.5  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.85 
 
 
612 aa  43.5  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1531  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.59 
 
 
409 aa  43.5  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>