102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3588 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.17 
 
 
722 aa  691    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  51.91 
 
 
797 aa  800    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  56.58 
 
 
757 aa  902    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  100 
 
 
764 aa  1597    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  55.2 
 
 
758 aa  900    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  56.6 
 
 
764 aa  912    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  36.66 
 
 
761 aa  467  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  35.45 
 
 
748 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  42.79 
 
 
641 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  30.74 
 
 
784 aa  306  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.63 
 
 
600 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  32.69 
 
 
763 aa  198  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
464 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  26.1 
 
 
435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  27.7 
 
 
431 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  25.75 
 
 
457 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  26.38 
 
 
466 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
423 aa  104  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.82 
 
 
472 aa  96.3  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  27.71 
 
 
448 aa  92.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  35.85 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
421 aa  82  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  23.3 
 
 
445 aa  77.4  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  30.67 
 
 
491 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  22.24 
 
 
600 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
414 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  24.62 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30.14 
 
 
606 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  23.87 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 
457 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 
453 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  21.63 
 
 
459 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  24.24 
 
 
619 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  30.56 
 
 
672 aa  67.4  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  24.17 
 
 
483 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.1 
 
 
582 aa  66.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  35.43 
 
 
531 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 
454 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.19 
 
 
584 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  28.26 
 
 
459 aa  65.5  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
460 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  23.46 
 
 
421 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  21.94 
 
 
445 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  24.12 
 
 
595 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  31.45 
 
 
454 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
457 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  30.87 
 
 
599 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
446 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 
441 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  27.91 
 
 
440 aa  61.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  32.54 
 
 
444 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  27.78 
 
 
624 aa  60.1  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  23.02 
 
 
621 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  31.9 
 
 
465 aa  58.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  28.99 
 
 
584 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  25 
 
 
668 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  28.06 
 
 
680 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  28 
 
 
531 aa  55.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
537 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  29.37 
 
 
601 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  32.56 
 
 
691 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  30.83 
 
 
696 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  30.09 
 
 
437 aa  52  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.71 
 
 
461 aa  52  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  19.66 
 
 
457 aa  51.6  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  27.69 
 
 
514 aa  51.2  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  29.46 
 
 
696 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  22.9 
 
 
595 aa  50.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  23.78 
 
 
543 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  31.01 
 
 
669 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  33.06 
 
 
679 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  33.06 
 
 
679 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  26.92 
 
 
595 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
455 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  25.78 
 
 
532 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3104  hypothetical protein  28.24 
 
 
558 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.74 
 
 
519 aa  48.5  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 
676 aa  48.5  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  26.77 
 
 
527 aa  48.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  29.57 
 
 
456 aa  48.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
468 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  29.58 
 
 
549 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  22.65 
 
 
595 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5071  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  55.26 
 
 
453 aa  46.6  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  27.73 
 
 
547 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  28.74 
 
 
595 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
538 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2896  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.96 
 
 
588 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217438  hitchhiker  0.000124211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  42.86 
 
 
577 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.62 
 
 
618 aa  45.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
534 aa  45.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  25.19 
 
 
530 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  31.19 
 
 
584 aa  44.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>