140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0951 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  894    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  34.71 
 
 		 445 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  32.25 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.2 
 
 		 472 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.85 
 
 		 459 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  31.04 
 
 		 454 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  31.29 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  30.68 
 
 		 478 aa  179  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  28.5 
 
 		 445 aa  169  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  27.85 
 
 		 456 aa  169  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  31.03 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  32.32 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  29.19 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 468 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  29.24 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  28.5 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  29.33 
 
 		 600 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  27.69 
 
 		 491 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  24.94 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  29.01 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  29.55 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  25.98 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  28.86 
 
 		 624 aa  130  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.33 
 
 		 672 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  26.85 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  29.29 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  26.83 
 
 		 606 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 483 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  24.5 
 
 		 764 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26 
 
 		 641 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  34.75 
 
 		 748 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  25.68 
 
 		 797 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.31 
 
 		 722 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  22.62 
 
 		 618 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  24.89 
 
 		 784 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  34.19 
 
 		 757 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  35.85 
 
 		 764 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  34.85 
 
 		 758 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  36.27 
 
 		 761 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.04 
 
 		 600 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  28.35 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  28.57 
 
 		 595 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  30.28 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  32.64 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  23.8 
 
 		 582 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  28.67 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  25 
 
 		 621 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  29.7 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  25.52 
 
 		 599 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  28.57 
 
 		 543 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  25.52 
 
 		 584 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  25.52 
 
 		 584 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  26.21 
 
 		 706 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  25 
 
 		 619 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  20.37 
 
 		 625 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0011  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  27.89 
 
 		 622 aa  50.1  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000229493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.48 
 
 		 540 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.02 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1923  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  32.26 
 
 		 626 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.206759  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  26.89 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  27.14 
 
 		 595 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1830  glucose inhibited division protein A  30.28 
 
 		 624 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.702094  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1446  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  38.95 
 
 		 621 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  24.8 
 
 		 549 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  47.92 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.24 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  47.92 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  25.53 
 
 		 514 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  27.73 
 
 		 530 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4998  glucose inhibited division protein A  29.38 
 
 		 640 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  62.5 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  31.4 
 
 		 340 aa  46.6  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  51.16 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.77 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.77 
 
 		 562 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>