66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6624 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  98.54 
 
 
433 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  99.76 
 
 
441 aa  828    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
411 aa  830    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  31.4 
 
 
444 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.32 
 
 
472 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  29.46 
 
 
445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  29.26 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
441 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
421 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
457 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
453 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  26.34 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
423 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  26.42 
 
 
432 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  27.07 
 
 
448 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.82 
 
 
459 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
445 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
457 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
446 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  23.74 
 
 
431 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
414 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
443 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  25.69 
 
 
435 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  26.28 
 
 
440 aa  99.8  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  28.16 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.33 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
454 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
457 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  24.27 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.26 
 
 
722 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  24.5 
 
 
465 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.23 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  33.33 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  26.24 
 
 
761 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  24.29 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  26.04 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.79 
 
 
600 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  24.51 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  34.23 
 
 
491 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  33.74 
 
 
672 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  24.2 
 
 
764 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  24.89 
 
 
748 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  31.1 
 
 
606 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  40.82 
 
 
797 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  27.68 
 
 
437 aa  66.2  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  23.58 
 
 
600 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
455 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  25.9 
 
 
784 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  29.45 
 
 
763 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  36.89 
 
 
624 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  31.93 
 
 
758 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 
468 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.74 
 
 
641 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  33.66 
 
 
757 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 
460 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 
462 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  33.33 
 
 
764 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  31.69 
 
 
454 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  24.83 
 
 
618 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  32.79 
 
 
588 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1648  heterodisulfide reductase, subunit A  58.82 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0282926  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  42.19 
 
 
517 aa  43.9  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>