94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1335 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 446 aa  887    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  92.31 
 
 		 445 aa  754    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  73.53 
 
 		 441 aa  631  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  70.5 
 
 		 440 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  54.63 
 
 		 451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  56.58 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 443 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.97 
 
 		 459 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  39.17 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 		 464 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.59 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  32.81 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  38.92 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  37.97 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  32.05 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 457 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  29.61 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 475 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  29.4 
 
 		 445 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  30.13 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.74 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 433 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  32.44 
 
 		 457 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  27.63 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.11 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  27.43 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  24.32 
 
 		 431 aa  123  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  28.9 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  26.75 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  26.65 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  25.22 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  28.77 
 
 		 624 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  27.51 
 
 		 483 aa  99.8  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  25.56 
 
 		 758 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 483 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  26.64 
 
 		 757 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  25.65 
 
 		 600 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  25.33 
 
 		 764 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  26.98 
 
 		 797 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  23.63 
 
 		 764 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  29.14 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  31.44 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  25.66 
 
 		 672 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  32.58 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  26.64 
 
 		 761 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  22.87 
 
 		 641 aa  63.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  31.32 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.34 
 
 		 600 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  31.15 
 
 		 748 aa  60.1  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  29.83 
 
 		 549 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  19.01 
 
 		 618 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.76 
 
 		 722 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.22 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.43 
 
 		 582 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  50.91 
 
 		 542 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 476 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  44.74 
 
 		 536 aa  50.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  28.35 
 
 		 535 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  27.87 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  22.54 
 
 		 619 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 		 534 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  26.43 
 
 		 784 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2507  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.19 
 
 		 602 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.32 
 
 		 642 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  44.07 
 
 		 587 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  39.68 
 
 		 549 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  44.07 
 
 		 587 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1023  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.83 
 
 		 685 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  42 
 
 		 561 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3480  hypothetical protein  55 
 
 		 623 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0582  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.4 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  29.11 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  25.34 
 
 		 595 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.5 
 
 		 519 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2896  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.66 
 
 		 588 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217438  hitchhiker  0.000124211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  27.75 
 
 		 506 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.76 
 
 		 643 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0465  thioredoxin reductase  63.16 
 
 		 305 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  24.9 
 
 		 595 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  46.15 
 
 		 525 aa  43.1  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>