More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4872 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  63.62 
 
 
535 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  63.93 
 
 
549 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
542 aa  1090    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  67.11 
 
 
536 aa  721    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  63.25 
 
 
540 aa  578  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.25 
 
 
540 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  52.05 
 
 
532 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  51.27 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  50.88 
 
 
532 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  50.88 
 
 
532 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.52 
 
 
522 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  50.58 
 
 
563 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  48.94 
 
 
545 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  45.49 
 
 
532 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  44.36 
 
 
526 aa  353  5.9999999999999994e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  26.21 
 
 
641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.03 
 
 
610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.86 
 
 
590 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.86 
 
 
568 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.86 
 
 
590 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.86 
 
 
590 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  26.86 
 
 
590 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.86 
 
 
590 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.02 
 
 
574 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5622  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.31 
 
 
591 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1661  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.31 
 
 
591 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.729694  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.02 
 
 
574 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  25.31 
 
 
576 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.58 
 
 
646 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.93 
 
 
562 aa  100  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  27.46 
 
 
954 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.09 
 
 
542 aa  98.2  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.74 
 
 
540 aa  96.7  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  25.64 
 
 
579 aa  94.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.35 
 
 
556 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  25.82 
 
 
579 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.4 
 
 
543 aa  90.9  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  25.64 
 
 
579 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  28.31 
 
 
646 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  24.91 
 
 
531 aa  87.4  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.66 
 
 
579 aa  87  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.71 
 
 
594 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  27.36 
 
 
522 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  24.44 
 
 
574 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.57 
 
 
552 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  25.05 
 
 
579 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.52 
 
 
564 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  24.51 
 
 
531 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  28.83 
 
 
533 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  24.07 
 
 
574 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  25.4 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  28.86 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  25.57 
 
 
573 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  24.72 
 
 
525 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.12 
 
 
648 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.12 
 
 
648 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.12 
 
 
648 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  25.05 
 
 
552 aa  82.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  22.85 
 
 
568 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  25.24 
 
 
579 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  25.95 
 
 
541 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  25.24 
 
 
579 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  25.24 
 
 
579 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  29.22 
 
 
513 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  23.77 
 
 
578 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  25.18 
 
 
539 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  21.97 
 
 
532 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  28.28 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  28.57 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  25.36 
 
 
540 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  23.6 
 
 
531 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  23.27 
 
 
531 aa  77.8  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  23.99 
 
 
582 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  23.86 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1746  L-aspartate oxidase  28.57 
 
 
553 aa  77.4  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0359487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  25.79 
 
 
576 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.84 
 
 
595 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  28.05 
 
 
558 aa  77  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  24.25 
 
 
583 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  25.54 
 
 
863 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.4 
 
 
644 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  24.86 
 
 
532 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.62 
 
 
605 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  28.1 
 
 
548 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.64 
 
 
589 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  28.1 
 
 
548 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  29.17 
 
 
509 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  24.5 
 
 
539 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  24.91 
 
 
552 aa  75.5  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  24.14 
 
 
540 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  23.99 
 
 
582 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  25.18 
 
 
540 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.36 
 
 
566 aa  75.5  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.14 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  22.61 
 
 
535 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  23.6 
 
 
580 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.14 
 
 
605 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  23.65 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  25 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  25 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>