More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3287 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  100 
 
 		 532 aa  1056    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.2 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  54.19 
 
 		 545 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  44.98 
 
 		 535 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  49.02 
 
 		 526 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  45.49 
 
 		 542 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  43.5 
 
 		 549 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  44.96 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  41.43 
 
 		 536 aa  355  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  42.69 
 
 		 532 aa  343  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.56 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  43.97 
 
 		 532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.97 
 
 		 532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.77 
 
 		 532 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  44.68 
 
 		 563 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  30.93 
 
 		 548 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  30.93 
 
 		 548 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.91 
 
 		 610 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  30.5 
 
 		 535 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  29.62 
 
 		 578 aa  87.8  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  27.48 
 
 		 576 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.24 
 
 		 540 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  27.7 
 
 		 578 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  27.76 
 
 		 578 aa  80.5  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.1 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  26.58 
 
 		 538 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  28.34 
 
 		 580 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  26.49 
 
 		 591 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  27.54 
 
 		 583 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  25.19 
 
 		 568 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  23.99 
 
 		 531 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  27.83 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  27.51 
 
 		 580 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  24.45 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  25.37 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.68 
 
 		 574 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  27.29 
 
 		 863 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.68 
 
 		 574 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  28.78 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  24.32 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.2 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 582 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  23.82 
 
 		 525 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  23.68 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  25.99 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  24.5 
 
 		 545 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  24.05 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.17 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  22.33 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  22.05 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2849  L-aspartate oxidase  24.52 
 
 		 535 aa  67  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  25.41 
 
 		 575 aa  67  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.33 
 
 		 543 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  25.84 
 
 		 574 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  25.27 
 
 		 574 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.33 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  22.2 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.65 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  27.79 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.12 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.34 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  23.12 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.12 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.69 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.12 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.12 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.12 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  22.55 
 
 		 531 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  26.53 
 
 		 558 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  28.3 
 
 		 641 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  27.11 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  27.11 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  22.02 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  27.27 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  23.27 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  23.34 
 
 		 509 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.58 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3933  L-aspartate oxidase  30.9 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  21.63 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  22.62 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  21.47 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  22.74 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  22.2 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5622  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.71 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1661  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.71 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.729694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  21.31 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  23.39 
 
 		 579 aa  60.1  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  27.15 
 
 		 548 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  22.2 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  22.2 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  25.13 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  27.16 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  22.2 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  28.73 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  22.39 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  24.68 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  25.9 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  22.91 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  23.28 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  23.08 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>