More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1635 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
590 aa  1214    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  99.82 
 
 
568 aa  1170    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
590 aa  1214    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  100 
 
 
590 aa  1214    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
590 aa  1214    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5622  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  99.83 
 
 
591 aa  1208    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1661  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  99.83 
 
 
591 aa  1208    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.729694  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
590 aa  1214    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.98 
 
 
579 aa  181  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.32 
 
 
542 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  27.85 
 
 
568 aa  147  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.49 
 
 
562 aa  143  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.89 
 
 
563 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  26.05 
 
 
579 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.2 
 
 
543 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  26.05 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  25.87 
 
 
579 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.78 
 
 
584 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.69 
 
 
594 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.42 
 
 
556 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  25.87 
 
 
579 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13349  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.57 
 
 
590 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  29.43 
 
 
584 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.12 
 
 
577 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.55 
 
 
574 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1587  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.92 
 
 
584 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243588  normal  0.596865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0312  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.19 
 
 
585 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.96 
 
 
598 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.31 
 
 
574 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.31 
 
 
574 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.73 
 
 
542 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.58 
 
 
584 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1228  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.58 
 
 
584 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.58 
 
 
584 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193625  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2104  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.7 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0119641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  27.21 
 
 
535 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.49 
 
 
600 aa  135  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  26.7 
 
 
591 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.41 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.67 
 
 
583 aa  134  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  27.41 
 
 
542 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  27.21 
 
 
535 aa  133  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.83 
 
 
583 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  27.03 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.61 
 
 
567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  24.92 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.85 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  25.48 
 
 
574 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.25 
 
 
626 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  26.13 
 
 
578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  26 
 
 
578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.66 
 
 
638 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3954  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.5 
 
 
610 aa  127  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  27.45 
 
 
582 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  26.15 
 
 
578 aa  126  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.38 
 
 
584 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  27.48 
 
 
535 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  26.55 
 
 
534 aa  126  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  25.95 
 
 
579 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  24.56 
 
 
574 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  25.95 
 
 
579 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  26.55 
 
 
580 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  27.42 
 
 
582 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.15 
 
 
583 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.78 
 
 
583 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.06 
 
 
596 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.2 
 
 
596 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.13 
 
 
610 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  25.78 
 
 
579 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.12 
 
 
595 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.55 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.95 
 
 
605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  26.76 
 
 
596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.55 
 
 
594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  26.42 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.76 
 
 
603 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03270  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit precursor, putative  25.61 
 
 
637 aa  122  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.164361  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.78 
 
 
598 aa  121  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.52 
 
 
567 aa  121  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  26.9 
 
 
954 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  25.09 
 
 
574 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.52 
 
 
566 aa  121  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.39 
 
 
595 aa  121  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.56 
 
 
605 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  25.31 
 
 
579 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  25.66 
 
 
534 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.51 
 
 
604 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.82 
 
 
595 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.11 
 
 
567 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  23.93 
 
 
532 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.88 
 
 
611 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  27.81 
 
 
534 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.05 
 
 
613 aa  120  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.81 
 
 
576 aa  120  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1902  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.05 
 
 
613 aa  120  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.77 
 
 
599 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  26.4 
 
 
528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  28.05 
 
 
572 aa  118  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.38 
 
 
583 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.24 
 
 
581 aa  118  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>