More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2057 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
556 aa  1162    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31 
 
 
574 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  29.83 
 
 
573 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  30.09 
 
 
574 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  30.09 
 
 
574 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  31.78 
 
 
569 aa  223  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  31.09 
 
 
579 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  30.92 
 
 
579 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  30.95 
 
 
579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  30.63 
 
 
576 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  30.47 
 
 
579 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  29.82 
 
 
574 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.8 
 
 
594 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.06 
 
 
579 aa  209  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  30.47 
 
 
579 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  30.59 
 
 
578 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  30.47 
 
 
579 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  29.52 
 
 
574 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  30.28 
 
 
579 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  29.34 
 
 
578 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  29.51 
 
 
563 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  29.78 
 
 
574 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  30.22 
 
 
580 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  30 
 
 
582 aa  197  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  30.55 
 
 
580 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  30.38 
 
 
954 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  30.05 
 
 
583 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  29.82 
 
 
582 aa  193  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  29.71 
 
 
591 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.17 
 
 
610 aa  190  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  29.29 
 
 
578 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.94 
 
 
566 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.05 
 
 
590 aa  177  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.86 
 
 
567 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.62 
 
 
567 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  29.41 
 
 
567 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.54 
 
 
627 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.7 
 
 
567 aa  156  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25 
 
 
591 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.1 
 
 
638 aa  153  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.64 
 
 
629 aa  150  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.81 
 
 
648 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.89 
 
 
567 aa  148  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.81 
 
 
648 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.81 
 
 
648 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.57 
 
 
567 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.54 
 
 
566 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  28.89 
 
 
567 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  25.78 
 
 
584 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.24 
 
 
564 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  28.35 
 
 
575 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.96 
 
 
570 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.9 
 
 
578 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.65 
 
 
644 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.67 
 
 
567 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.17 
 
 
646 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.84 
 
 
579 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.38 
 
 
579 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.03 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.84 
 
 
581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.99 
 
 
582 aa  135  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.62 
 
 
552 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  26.38 
 
 
568 aa  133  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.7 
 
 
623 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.98 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2104  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.52 
 
 
574 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0119641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.69 
 
 
643 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  27.42 
 
 
542 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  27.01 
 
 
532 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.08 
 
 
598 aa  130  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  28.51 
 
 
646 aa  130  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.1 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  25.34 
 
 
582 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.12 
 
 
575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.71 
 
 
540 aa  127  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  23.91 
 
 
634 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.21 
 
 
622 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2832  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.24 
 
 
609 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0155951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  26.58 
 
 
576 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  26.12 
 
 
632 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  28.39 
 
 
572 aa  124  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.88 
 
 
577 aa  124  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  27.04 
 
 
528 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  26.28 
 
 
596 aa  123  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13349  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.19 
 
 
590 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.51 
 
 
539 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.03 
 
 
608 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  26.32 
 
 
573 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.52 
 
 
581 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  26.04 
 
 
591 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.89 
 
 
543 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.09 
 
 
583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.17 
 
 
539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0936  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.95 
 
 
612 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  26.73 
 
 
584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.62 
 
 
576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.31 
 
 
575 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.04 
 
 
562 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.77 
 
 
612 aa  121  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.864322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1228  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.49 
 
 
584 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>