More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3480 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
540 aa  1087    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  57.06 
 
 
535 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  56.7 
 
 
542 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  55.06 
 
 
536 aa  535  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  55.47 
 
 
549 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.14 
 
 
540 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.77 
 
 
522 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  46.01 
 
 
545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.06 
 
 
532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.53 
 
 
532 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  47.53 
 
 
532 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.53 
 
 
532 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  46.8 
 
 
563 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  44.97 
 
 
532 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  42.15 
 
 
526 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.16 
 
 
610 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.84 
 
 
556 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.33 
 
 
638 aa  81.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  31.95 
 
 
513 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.25 
 
 
646 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  26.7 
 
 
954 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.51 
 
 
576 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
590 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  24.73 
 
 
590 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
590 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
590 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
590 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  24.74 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
568 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  23.41 
 
 
568 aa  74.3  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  24.42 
 
 
578 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  23.84 
 
 
574 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  23.84 
 
 
574 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5622  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.54 
 
 
591 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1661  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.54 
 
 
591 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.729694  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  25.18 
 
 
591 aa  70.5  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.02 
 
 
564 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.84 
 
 
623 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  24.91 
 
 
574 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  24.86 
 
 
578 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  24.01 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 
641 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  24.2 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  25 
 
 
569 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  25.64 
 
 
583 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  23.09 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  23.82 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  27.41 
 
 
522 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  24.02 
 
 
579 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  29.59 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  27.31 
 
 
646 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  25.19 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  23.74 
 
 
579 aa  67  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1249  L-aspartate oxidase  26.56 
 
 
532 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00428614  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.17 
 
 
562 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.51 
 
 
579 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  25.93 
 
 
550 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.6 
 
 
540 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25 
 
 
648 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  25.4 
 
 
580 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25 
 
 
648 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.58 
 
 
648 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  25.51 
 
 
574 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.19 
 
 
588 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  26.3 
 
 
545 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.74 
 
 
598 aa  64.7  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.17 
 
 
644 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  22.83 
 
 
515 aa  63.9  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.96 
 
 
575 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  26.8 
 
 
584 aa  63.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  22.74 
 
 
558 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.58 
 
 
567 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  22.74 
 
 
557 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2375  L-aspartate oxidase  22.27 
 
 
559 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  29.65 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.19 
 
 
596 aa  62.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  24.59 
 
 
587 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  26.54 
 
 
572 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2665  L-aspartate oxidase  25.76 
 
 
538 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.16 
 
 
621 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  23.96 
 
 
580 aa  62  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  24.19 
 
 
582 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  28.02 
 
 
558 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  26.88 
 
 
863 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.29 
 
 
583 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.92 
 
 
555 aa  60.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.59 
 
 
588 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0642  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.12 
 
 
588 aa  60.5  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  24.86 
 
 
591 aa  60.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.16 
 
 
680 aa  60.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2912  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.12 
 
 
588 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.303768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0736  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.12 
 
 
588 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  22.85 
 
 
535 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0815  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.12 
 
 
588 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.233209  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0771  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.12 
 
 
588 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  24.01 
 
 
582 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.16 
 
 
644 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  27.18 
 
 
548 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00672  hypothetical protein  22.12 
 
 
588 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.67 
 
 
627 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>