More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21930 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  100 
 
 
545 aa  1089    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.77 
 
 
522 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  54.19 
 
 
532 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  45.98 
 
 
535 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  48.19 
 
 
549 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  48.94 
 
 
542 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.88 
 
 
536 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  48.55 
 
 
526 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.42 
 
 
540 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.78 
 
 
540 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  46.08 
 
 
563 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.35 
 
 
532 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.87 
 
 
532 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  43.49 
 
 
532 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.49 
 
 
532 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.6 
 
 
610 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.4 
 
 
556 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.01 
 
 
542 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.55 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.19 
 
 
576 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.25 
 
 
540 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.18 
 
 
582 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  26.67 
 
 
580 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.79 
 
 
543 aa  78.2  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.29 
 
 
574 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.29 
 
 
574 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  26.59 
 
 
545 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  25 
 
 
582 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  27.57 
 
 
535 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  25 
 
 
580 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3933  L-aspartate oxidase  30.21 
 
 
544 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  25.46 
 
 
591 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  27.89 
 
 
548 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.48 
 
 
589 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  27.89 
 
 
548 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  27.41 
 
 
583 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.64 
 
 
542 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.26 
 
 
542 aa  74.7  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  26.33 
 
 
575 aa  73.9  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.6 
 
 
598 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.3 
 
 
587 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  26.96 
 
 
578 aa  72  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  27.67 
 
 
954 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  23.24 
 
 
531 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.65 
 
 
680 aa  70.5  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  25.61 
 
 
538 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  20.87 
 
 
542 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  23.71 
 
 
533 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  24.12 
 
 
579 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  26.15 
 
 
535 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  27.11 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  25.65 
 
 
522 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.38 
 
 
594 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  24.13 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  29.8 
 
 
514 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  30.08 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  27.55 
 
 
646 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  25.82 
 
 
576 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25 
 
 
608 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.65 
 
 
644 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  24.38 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.52 
 
 
600 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.38 
 
 
588 aa  68.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  22.65 
 
 
534 aa  68.2  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.92 
 
 
564 aa  68.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  21.97 
 
 
532 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  21.88 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  24.6 
 
 
579 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  23.99 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  26.18 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  23.63 
 
 
579 aa  67  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  23.92 
 
 
539 aa  66.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.25 
 
 
588 aa  66.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  21.97 
 
 
531 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  24.68 
 
 
578 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  23.76 
 
 
576 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  24.75 
 
 
596 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  22.98 
 
 
537 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  22.96 
 
 
534 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  22.05 
 
 
511 aa  65.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  23.66 
 
 
574 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0032  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.7 
 
 
532 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  24.26 
 
 
574 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  26.8 
 
 
533 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 
641 aa  65.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  23.44 
 
 
539 aa  65.1  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.35 
 
 
627 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0982  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 
565 aa  64.7  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000258616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  26.8 
 
 
533 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.25 
 
 
598 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  22.36 
 
 
550 aa  64.7  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2374  L-aspartate oxidase  25.06 
 
 
558 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.92 
 
 
568 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  21.01 
 
 
531 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.92 
 
 
590 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  22.18 
 
 
531 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  25.92 
 
 
590 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  28.71 
 
 
519 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.92 
 
 
590 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.92 
 
 
590 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>