More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0012 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  62.97 
 
 		 532 aa  703    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4734  L-aspartate oxidase  60.42 
 
 		 526 aa  666    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 528 aa  1094    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  59.58 
 
 		 528 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 531 aa  605  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  55.68 
 
 		 531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  55.53 
 
 		 537 aa  597  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  54.16 
 
 		 533 aa  594  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  53.96 
 
 		 531 aa  591  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  55.03 
 
 		 531 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  54.63 
 
 		 531 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  53.7 
 
 		 531 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  52.62 
 
 		 531 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 		 531 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  51.36 
 
 		 533 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  51.36 
 
 		 533 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  51.84 
 
 		 531 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  51.25 
 
 		 534 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  50.97 
 
 		 531 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  49.05 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  50.19 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  47.65 
 
 		 550 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  52.4 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  49.25 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  48.86 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  48.02 
 
 		 538 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  48.58 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  48.67 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  48.59 
 
 		 538 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  49.32 
 
 		 532 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  48.48 
 
 		 534 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  47.83 
 
 		 538 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  50.68 
 
 		 539 aa  505  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  47.08 
 
 		 537 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  47.08 
 
 		 537 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  47.27 
 
 		 537 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  48.22 
 
 		 543 aa  502  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  47.16 
 
 		 545 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  47.08 
 
 		 537 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  48.4 
 
 		 538 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  47.69 
 
 		 537 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  46.72 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  47.16 
 
 		 533 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  47.69 
 
 		 537 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  47.15 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  47.69 
 
 		 537 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  47.16 
 
 		 533 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  47.93 
 
 		 538 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  47.93 
 
 		 532 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  48.4 
 
 		 538 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  47.27 
 
 		 537 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  48.21 
 
 		 543 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  46.79 
 
 		 538 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  46.79 
 
 		 538 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  47.5 
 
 		 537 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  47.08 
 
 		 537 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  47.46 
 
 		 538 aa  491  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  47.65 
 
 		 534 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  46.2 
 
 		 533 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  46.39 
 
 		 528 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  47.72 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002490  L-aspartate oxidase  47.65 
 
 		 561 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79354  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  46.98 
 
 		 532 aa  492  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  47.16 
 
 		 534 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  47.34 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  47.32 
 
 		 537 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  46.34 
 
 		 536 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  47.08 
 
 		 538 aa  492  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  48.16 
 
 		 533 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  47.65 
 
 		 534 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  46.34 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  46.2 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  46.4 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  48.86 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  47.27 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  47.87 
 
 		 579 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03543  L-aspartate oxidase  47.08 
 
 		 559 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  47.27 
 
 		 534 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  46.33 
 
 		 535 aa  488  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 		 545 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  47.24 
 
 		 534 aa  487  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  46.21 
 
 		 533 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  46.01 
 
 		 533 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  46.4 
 
 		 523 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  47.35 
 
 		 534 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 		 540 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  46.21 
 
 		 540 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  46.64 
 
 		 539 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  46.72 
 
 		 552 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  45.57 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  45.83 
 
 		 540 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 		 539 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  46.44 
 
 		 541 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  45.83 
 
 		 540 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  46.12 
 
 		 541 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  47.5 
 
 		 532 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  47.01 
 
 		 540 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 		 540 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  46.21 
 
 		 540 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  47.24 
 
 		 542 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>