More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6149 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  69.66 
 
 
582 aa  854    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  67.38 
 
 
574 aa  795    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  69.03 
 
 
574 aa  830    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  69.11 
 
 
579 aa  837    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  83.54 
 
 
578 aa  1013    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  71.02 
 
 
578 aa  847    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  69.43 
 
 
578 aa  838    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  61.55 
 
 
569 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  71 
 
 
580 aa  857    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  67.85 
 
 
576 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  69.06 
 
 
579 aa  838    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  70 
 
 
582 aa  860    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  69.03 
 
 
574 aa  830    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  67.43 
 
 
574 aa  811    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  100 
 
 
583 aa  1214    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  69.61 
 
 
591 aa  839    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  92.06 
 
 
580 aa  1085    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  68.94 
 
 
579 aa  823    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  68.94 
 
 
579 aa  823    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  69.11 
 
 
579 aa  837    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  69.28 
 
 
579 aa  841    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  67.08 
 
 
574 aa  797    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  69.11 
 
 
579 aa  825    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  55.59 
 
 
954 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.27 
 
 
610 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  37.24 
 
 
573 aa  362  8e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.29 
 
 
574 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.39 
 
 
579 aa  229  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.97 
 
 
594 aa  223  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.64 
 
 
556 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.4 
 
 
590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28.73 
 
 
566 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.21 
 
 
563 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.25 
 
 
564 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.67 
 
 
591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.6 
 
 
634 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  26.33 
 
 
568 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.1 
 
 
590 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.02 
 
 
598 aa  130  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.74 
 
 
635 aa  127  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.17 
 
 
635 aa  127  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.43 
 
 
563 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.85 
 
 
588 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  25.25 
 
 
632 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.7 
 
 
590 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.7 
 
 
590 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.59 
 
 
658 aa  125  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.62 
 
 
622 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.38 
 
 
659 aa  122  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004114  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.7 
 
 
588 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27 
 
 
588 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.31 
 
 
627 aa  118  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.84 
 
 
629 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.12 
 
 
622 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.25 
 
 
590 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.29 
 
 
588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2505  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.65 
 
 
590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.65 
 
 
589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.12 
 
 
625 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.17 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.66 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  26.28 
 
 
590 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.85 
 
 
590 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.45 
 
 
617 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.42 
 
 
657 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.88 
 
 
588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3514  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.91 
 
 
590 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22318  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1142  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.77 
 
 
589 aa  114  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.881943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2916  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.55 
 
 
588 aa  114  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.35 
 
 
587 aa  114  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.41 
 
 
588 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4191  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.72 
 
 
590 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1663  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.72 
 
 
590 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3762  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.72 
 
 
590 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.54 
 
 
587 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.98 
 
 
588 aa  113  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.35 
 
 
587 aa  113  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  25.24 
 
 
591 aa  113  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.74 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3102  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.98 
 
 
588 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.15 
 
 
658 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29790  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.63 
 
 
439 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.09 
 
 
595 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.33 
 
 
588 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.431118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2883  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.33 
 
 
588 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0212451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1382  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.33 
 
 
588 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332477  normal  0.921061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.83 
 
 
588 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0767  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.55 
 
 
588 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0793  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.55 
 
 
588 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83395  normal  0.0589165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0857  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.55 
 
 
588 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484772 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0828  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.55 
 
 
588 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0890  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.55 
 
 
588 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.53 
 
 
581 aa  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.8 
 
 
588 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.27 
 
 
581 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0642  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.34 
 
 
588 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.43 
 
 
579 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1835  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.41 
 
 
588 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132672  normal  0.110124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  26.1 
 
 
567 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2271  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.74 
 
 
588 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>