More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3933 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4589  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 		 549 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4301  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  65.65 
 
 		 549 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346412  decreased coverage  0.00817014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3933  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 544 aa  1073    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2911  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  48 
 
 		 531 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0644438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2665  L-aspartate oxidase  48.63 
 
 		 538 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1249  L-aspartate oxidase  48.94 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00428614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  46.73 
 
 		 555 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1746  L-aspartate oxidase  46.88 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0982  L-aspartate oxidase  44.27 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000258616  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.07 
 
 		 542 aa  256  7e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.65 
 
 		 589 aa  250  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.13 
 
 		 608 aa  243  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.04 
 
 		 638 aa  238  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.47 
 
 		 646 aa  236  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.9 
 
 		 644 aa  233  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  40.05 
 
 		 609 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  40.39 
 
 		 528 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  39.47 
 
 		 646 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.68 
 
 		 539 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.93 
 
 		 646 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.15 
 
 		 623 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 		 648 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 		 648 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 		 648 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.7 
 
 		 644 aa  223  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.54 
 
 		 539 aa  223  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  35.41 
 
 		 584 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.94 
 
 		 540 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.37 
 
 		 542 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.62 
 
 		 543 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  41.11 
 
 		 558 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.25 
 
 		 570 aa  220  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.96 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.72 
 
 		 563 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.03 
 
 		 539 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  35.11 
 
 		 534 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  37.31 
 
 		 533 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.45 
 
 		 546 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.43 
 
 		 542 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  37.39 
 
 		 529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  33.81 
 
 		 582 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  36.6 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  37.35 
 
 		 535 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  37.12 
 
 		 535 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.78 
 
 		 598 aa  212  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  34.99 
 
 		 542 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  37.12 
 
 		 535 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  37.77 
 
 		 576 aa  210  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.93 
 
 		 627 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  35.99 
 
 		 534 aa  208  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.32 
 
 		 621 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  38.65 
 
 		 863 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  33.71 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  35.04 
 
 		 539 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4056  L-aspartate oxidase  32.93 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.916074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.66 
 
 		 681 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  39.72 
 
 		 598 aa  203  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  38.12 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  34.54 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  36.59 
 
 		 641 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  35.56 
 
 		 531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.73 
 
 		 583 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  34.64 
 
 		 532 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  34.71 
 
 		 531 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  40.51 
 
 		 545 aa  200  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  38.8 
 
 		 598 aa  200  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  33.26 
 
 		 534 aa  200  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  36.75 
 
 		 527 aa  200  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  35.92 
 
 		 533 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  36.06 
 
 		 546 aa  199  9e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  38.06 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  33.87 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  36.63 
 
 		 568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.42 
 
 		 637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  33.33 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  35.56 
 
 		 565 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  34.45 
 
 		 579 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  34.61 
 
 		 531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.91 
 
 		 575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  34.08 
 
 		 525 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.26 
 
 		 578 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0383  L-aspartate oxidase  32.41 
 
 		 439 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  38.9 
 
 		 847 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  34.69 
 
 		 534 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  36.45 
 
 		 545 aa  197  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  33.33 
 
 		 561 aa  196  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  36.2 
 
 		 529 aa  196  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  35 
 
 		 541 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  35.32 
 
 		 560 aa  196  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.2 
 
 		 637 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  32.52 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  33.89 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.16 
 
 		 567 aa  195  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  34.06 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  37.08 
 
 		 543 aa  196  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.8 
 
 		 617 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  35.35 
 
 		 539 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  35.44 
 
 		 540 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>