More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4485 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  71.66 
 
 
847 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  64.43 
 
 
557 aa  634    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  67.76 
 
 
863 aa  695    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  100 
 
 
545 aa  1057    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  65.47 
 
 
598 aa  631  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  64.83 
 
 
575 aa  619  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  65.91 
 
 
867 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  64.61 
 
 
566 aa  611  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  63.72 
 
 
548 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  63.05 
 
 
549 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  61.18 
 
 
872 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  62.8 
 
 
558 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  60.32 
 
 
572 aa  548  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 
577 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  59.64 
 
 
572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 
572 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  57.29 
 
 
589 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  47 
 
 
532 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  42.78 
 
 
532 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  45.94 
 
 
533 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  42.24 
 
 
534 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  49.52 
 
 
507 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 
542 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  50 
 
 
538 aa  415  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  43.26 
 
 
538 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  48.45 
 
 
541 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  47.16 
 
 
528 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  50.87 
 
 
548 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  51.11 
 
 
538 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  52.68 
 
 
538 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  48.57 
 
 
529 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  50.87 
 
 
548 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  44.36 
 
 
532 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  50.29 
 
 
535 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  50.58 
 
 
557 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  47.32 
 
 
522 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  45.16 
 
 
515 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  42.27 
 
 
531 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  42.53 
 
 
531 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  50.97 
 
 
519 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  45.71 
 
 
535 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
531 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  45.89 
 
 
515 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 
531 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  41.42 
 
 
531 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  45.66 
 
 
535 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  44.17 
 
 
550 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  45.84 
 
 
535 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  51.26 
 
 
514 aa  379  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  46.26 
 
 
533 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  46.73 
 
 
502 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  44.1 
 
 
556 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  45.76 
 
 
535 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  46.14 
 
 
534 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  46.17 
 
 
518 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  41.23 
 
 
537 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  41.23 
 
 
531 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  41.54 
 
 
509 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  41.34 
 
 
509 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  41.55 
 
 
571 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  42.47 
 
 
519 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  48.04 
 
 
527 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  39.92 
 
 
532 aa  364  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  46.48 
 
 
535 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 
509 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  45.63 
 
 
537 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
565 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  47.07 
 
 
534 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  44.42 
 
 
528 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  43.99 
 
 
609 aa  359  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 
509 aa  359  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 
509 aa  359  7e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  41.92 
 
 
531 aa  359  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  41.17 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  46.39 
 
 
540 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  41.72 
 
 
509 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  43.49 
 
 
545 aa  356  6.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  46.37 
 
 
529 aa  356  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  41.13 
 
 
509 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  45.79 
 
 
539 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  45.21 
 
 
532 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  43.57 
 
 
533 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  40.55 
 
 
539 aa  353  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  41.84 
 
 
536 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  43.31 
 
 
532 aa  353  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  42.19 
 
 
579 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  42.4 
 
 
531 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
533 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  42.48 
 
 
533 aa  349  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  42.13 
 
 
538 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  42.69 
 
 
538 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  42.69 
 
 
538 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  43.05 
 
 
535 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  45.99 
 
 
529 aa  348  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.78 
 
 
531 aa  347  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  41.09 
 
 
555 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  45.27 
 
 
516 aa  346  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 
536 aa  346  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 
533 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 
538 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>