More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1228 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  81.63 
 
 		 538 aa  802    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  90.38 
 
 		 540 aa  906    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  81.26 
 
 		 534 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 539 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  62.38 
 
 		 532 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  61.89 
 
 		 537 aa  571  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  62.11 
 
 		 532 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  58.22 
 
 		 532 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  52.39 
 
 		 531 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  53.66 
 
 		 521 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  52.42 
 
 		 509 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  52.63 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  50.3 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  51.39 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  52.56 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  47.47 
 
 		 512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  52.26 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  50.5 
 
 		 519 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  49.6 
 
 		 517 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  47.89 
 
 		 522 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.93 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  52.54 
 
 		 500 aa  389  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  47.47 
 
 		 512 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  50.75 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  48.92 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 		 532 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  53.2 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  46.09 
 
 		 518 aa  372  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  51.91 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.55 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  40.84 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  47.78 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  42.61 
 
 		 541 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  53.65 
 
 		 507 aa  359  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  46.29 
 
 		 867 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  45.88 
 
 		 545 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  40.55 
 
 		 532 aa  353  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 		 534 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  47.5 
 
 		 502 aa  349  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 		 542 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  44.1 
 
 		 863 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  47.8 
 
 		 548 aa  348  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  49.39 
 
 		 513 aa  347  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  45.91 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  44.96 
 
 		 507 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  44.99 
 
 		 847 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  41.39 
 
 		 522 aa  340  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 		 598 aa  339  9e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  40.7 
 
 		 533 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  42.18 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  45.49 
 
 		 572 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  42.54 
 
 		 533 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  43.94 
 
 		 557 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  42.77 
 
 		 552 aa  333  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  42.54 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  39.59 
 
 		 543 aa  333  7.000000000000001e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  45.38 
 
 		 566 aa  331  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  41.23 
 
 		 545 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  40.49 
 
 		 533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  40.28 
 
 		 528 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  42.17 
 
 		 530 aa  329  9e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  37.5 
 
 		 531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  41.84 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  41.84 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  40.35 
 
 		 515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  43.17 
 
 		 575 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  40.56 
 
 		 539 aa  327  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  41.81 
 
 		 552 aa  326  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  41.36 
 
 		 577 aa  326  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  42.59 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  37.55 
 
 		 531 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  39.96 
 
 		 515 aa  325  2e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  38.34 
 
 		 519 aa  325  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  36.38 
 
 		 509 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  40.7 
 
 		 534 aa  324  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  37.15 
 
 		 509 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 		 541 aa  323  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  36.84 
 
 		 531 aa  322  8e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  39.92 
 
 		 536 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  37.1 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  37.35 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  37.1 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 		 536 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  37.77 
 
 		 516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  36.96 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  37.6 
 
 		 531 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 		 537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  40.31 
 
 		 536 aa  321  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  36.91 
 
 		 537 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 		 532 aa  320  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  36.71 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  36.71 
 
 		 509 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  39.19 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  39.78 
 
 		 538 aa  316  6e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  40.41 
 
 		 538 aa  316  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  41.49 
 
 		 532 aa  316  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  44.11 
 
 		 572 aa  316  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  35.92 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  39.58 
 
 		 538 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>