More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2816 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 		 537 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  69.74 
 
 		 570 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  65.98 
 
 		 542 aa  697    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  63.21 
 
 		 534 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  64.03 
 
 		 533 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  71.7 
 
 		 533 aa  747    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  71.73 
 
 		 532 aa  758    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 		 537 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  60.19 
 
 		 532 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  59.89 
 
 		 537 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  63.08 
 
 		 538 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 		 537 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  63.48 
 
 		 531 aa  653    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  63.4 
 
 		 534 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  69.74 
 
 		 535 aa  746    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  64.22 
 
 		 541 aa  665    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  70.89 
 
 		 528 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  63.27 
 
 		 538 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  68.98 
 
 		 525 aa  735    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  62.97 
 
 		 552 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  72.68 
 
 		 528 aa  771    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  69.07 
 
 		 541 aa  715    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  64.93 
 
 		 543 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  69.74 
 
 		 533 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  60.71 
 
 		 539 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  63.47 
 
 		 538 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  71.08 
 
 		 528 aa  749    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  82.95 
 
 		 528 aa  858    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  71.08 
 
 		 528 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  62.08 
 
 		 552 aa  661    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  62.83 
 
 		 534 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  83.24 
 
 		 523 aa  873    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  59.7 
 
 		 536 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  59.32 
 
 		 550 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  63.01 
 
 		 538 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 536 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  69.42 
 
 		 534 aa  746    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  69.74 
 
 		 570 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  69.17 
 
 		 533 aa  738    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  71.32 
 
 		 533 aa  750    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  70.57 
 
 		 528 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  60.23 
 
 		 534 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  80.8 
 
 		 536 aa  831    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  60.23 
 
 		 555 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  66.16 
 
 		 538 aa  720    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  66.16 
 
 		 538 aa  720    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  82.49 
 
 		 541 aa  885    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  70.78 
 
 		 532 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  60.3 
 
 		 537 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  69.74 
 
 		 570 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  99.43 
 
 		 529 aa  1066    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  72.68 
 
 		 535 aa  768    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  71.13 
 
 		 533 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  63.57 
 
 		 538 aa  687    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  69.74 
 
 		 570 aa  746    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  70.89 
 
 		 528 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1097  L-aspartate oxidase  59.08 
 
 		 531 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.565133  normal  0.0527143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  69.45 
 
 		 532 aa  730    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  59.89 
 
 		 536 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  59.89 
 
 		 537 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  59.89 
 
 		 537 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  59.07 
 
 		 538 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  63.21 
 
 		 535 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  71.08 
 
 		 528 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  62.45 
 
 		 538 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  66.54 
 
 		 530 aa  683    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  70.89 
 
 		 528 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  59.51 
 
 		 537 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 529 aa  1073    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  59.7 
 
 		 537 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  60.53 
 
 		 539 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  70.97 
 
 		 532 aa  747    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  61.95 
 
 		 560 aa  639    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  60.26 
 
 		 535 aa  650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  59.96 
 
 		 537 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  69.74 
 
 		 570 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  61.06 
 
 		 542 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 		 537 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  84.21 
 
 		 529 aa  858    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  85.52 
 
 		 525 aa  892    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  64.47 
 
 		 544 aa  632  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  59.4 
 
 		 533 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  59.7 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  59.4 
 
 		 533 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  57.33 
 
 		 543 aa  628  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  59.77 
 
 		 533 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  59.77 
 
 		 545 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  58.08 
 
 		 533 aa  625  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  59.77 
 
 		 533 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2315  L-aspartate oxidase  61.76 
 
 		 528 aa  626  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  58.35 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  61.32 
 
 		 563 aa  624  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  59.58 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  59.58 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  61.47 
 
 		 546 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  58.52 
 
 		 539 aa  621  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  59.58 
 
 		 539 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  58.35 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  59.77 
 
 		 540 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  58.35 
 
 		 540 aa  620  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>