More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  71.74 
 
 
538 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  100 
 
 
557 aa  1077    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  60.07 
 
 
538 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  56.07 
 
 
548 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  56.07 
 
 
548 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  55.68 
 
 
535 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  55.73 
 
 
514 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  55.23 
 
 
519 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  53.27 
 
 
847 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  50.53 
 
 
863 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  49.82 
 
 
867 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  50.46 
 
 
545 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  51.39 
 
 
558 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  54.37 
 
 
527 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  49.04 
 
 
566 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  47.72 
 
 
557 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  47.88 
 
 
577 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  48.93 
 
 
598 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  49.55 
 
 
572 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  49.72 
 
 
548 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  41.02 
 
 
532 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  49.25 
 
 
575 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  51.78 
 
 
872 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  51.85 
 
 
533 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  49.05 
 
 
549 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  42.31 
 
 
534 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  45.62 
 
 
507 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  43.04 
 
 
541 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  49.82 
 
 
572 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  41.53 
 
 
534 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2011  L-aspartate oxidase  51.88 
 
 
482 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  41.24 
 
 
531 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 
531 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 
532 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  41.09 
 
 
531 aa  365  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.94 
 
 
531 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  40 
 
 
538 aa  359  7e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  41.3 
 
 
532 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  43.1 
 
 
533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  40.62 
 
 
533 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.59 
 
 
542 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  42.05 
 
 
536 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
535 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  40.62 
 
 
533 aa  352  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  43.23 
 
 
542 aa  352  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  42.75 
 
 
534 aa  352  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  44.49 
 
 
541 aa  350  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
535 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  42.67 
 
 
535 aa  349  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  38.63 
 
 
531 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  39.93 
 
 
539 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  43.45 
 
 
546 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  48.08 
 
 
572 aa  348  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  38.38 
 
 
579 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  43.98 
 
 
522 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  43.49 
 
 
534 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  43.49 
 
 
534 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  40.3 
 
 
534 aa  347  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  40.76 
 
 
539 aa  346  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  42.38 
 
 
515 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  41.85 
 
 
535 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  43.04 
 
 
535 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  45 
 
 
534 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  37.84 
 
 
537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 
536 aa  343  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 
527 aa  343  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  43.68 
 
 
534 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  41.9 
 
 
515 aa  343  5e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  41.28 
 
 
537 aa  342  8e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  40.92 
 
 
537 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 
533 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  40.92 
 
 
537 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  40.92 
 
 
537 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  40.33 
 
 
561 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  42.27 
 
 
538 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  41.44 
 
 
537 aa  342  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  40.92 
 
 
537 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  41.57 
 
 
533 aa  341  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 
532 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  44.36 
 
 
529 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  41.7 
 
 
542 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  36.99 
 
 
531 aa  341  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  43.48 
 
 
532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  44.02 
 
 
538 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  40.92 
 
 
537 aa  340  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 
528 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  43.67 
 
 
532 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  43.41 
 
 
535 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 
533 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 
570 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  41.9 
 
 
538 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 
570 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 
570 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 
570 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 
570 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  40.55 
 
 
537 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  43.18 
 
 
532 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 
537 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  42.27 
 
 
538 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  37.13 
 
 
531 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>