More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  72.95 
 
 
589 aa  739    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  70.6 
 
 
572 aa  706    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  100 
 
 
577 aa  1129    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  60.43 
 
 
847 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  58.66 
 
 
863 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  57.63 
 
 
598 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  60.19 
 
 
575 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  54.76 
 
 
557 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 
545 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  56.91 
 
 
572 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  54.99 
 
 
867 aa  511  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  54.71 
 
 
558 aa  508  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  55.86 
 
 
566 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  56.19 
 
 
548 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  54.18 
 
 
549 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  55.13 
 
 
572 aa  495  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  53.59 
 
 
872 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  45.83 
 
 
532 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  47.69 
 
 
529 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  47.33 
 
 
507 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  48.53 
 
 
538 aa  405  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  40.83 
 
 
542 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  41.08 
 
 
538 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  45.34 
 
 
533 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  39.49 
 
 
532 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  43.22 
 
 
528 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  44.01 
 
 
522 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  39.93 
 
 
532 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  44.06 
 
 
515 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  42.93 
 
 
579 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  44.02 
 
 
515 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  43.92 
 
 
533 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  43.2 
 
 
531 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 
532 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
556 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  40.44 
 
 
534 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  48.28 
 
 
538 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  46.89 
 
 
538 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  42.73 
 
 
535 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  40.73 
 
 
539 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  40.71 
 
 
531 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 
534 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  43.38 
 
 
541 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  44.38 
 
 
541 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  42.6 
 
 
542 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  41.14 
 
 
531 aa  359  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  43.09 
 
 
534 aa  360  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  40.59 
 
 
531 aa  359  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  41.61 
 
 
565 aa  359  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  41.83 
 
 
535 aa  359  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 
535 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  48.4 
 
 
557 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  39.74 
 
 
531 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  41.25 
 
 
536 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.82 
 
 
535 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  39.85 
 
 
531 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  44.03 
 
 
529 aa  355  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  45.45 
 
 
523 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  41.45 
 
 
540 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  41.3 
 
 
540 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  41.45 
 
 
540 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 
531 aa  353  5e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  42.06 
 
 
545 aa  353  5e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  40.97 
 
 
540 aa  353  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  41.45 
 
 
540 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 
540 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 
540 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 
540 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  41.08 
 
 
539 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  41.45 
 
 
540 aa  352  8e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  41.87 
 
 
543 aa  352  1e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  43.3 
 
 
534 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 
546 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  40.37 
 
 
539 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  41.34 
 
 
540 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 
539 aa  349  6e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  40.37 
 
 
531 aa  349  6e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  41.26 
 
 
540 aa  349  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  41.04 
 
 
530 aa  349  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  40.43 
 
 
545 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  40.81 
 
 
537 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  40.69 
 
 
538 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  43.81 
 
 
525 aa  347  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  41.06 
 
 
533 aa  347  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  40.44 
 
 
537 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  40.44 
 
 
537 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  39.74 
 
 
531 aa  346  6e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  40.44 
 
 
537 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  38.79 
 
 
531 aa  346  7e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  40.69 
 
 
533 aa  346  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  43.58 
 
 
541 aa  346  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  42.96 
 
 
533 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 
535 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  40.81 
 
 
560 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 
534 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  41.26 
 
 
537 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  40.26 
 
 
537 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  44.07 
 
 
534 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  43.84 
 
 
529 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  37.99 
 
 
543 aa  345  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>