More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4982 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  67.35 
 
 
867 aa  1022    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  61.33 
 
 
847 aa  907    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  100 
 
 
872 aa  1682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  61.18 
 
 
863 aa  924    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  61.18 
 
 
545 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  60.51 
 
 
575 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  58.94 
 
 
598 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  59.07 
 
 
566 aa  522  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  55.17 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  53.59 
 
 
577 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  57.58 
 
 
558 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  58.11 
 
 
572 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  58.43 
 
 
549 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  56.88 
 
 
572 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  56.44 
 
 
548 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  57.74 
 
 
572 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  53.94 
 
 
589 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  43.65 
 
 
532 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  51.32 
 
 
538 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  52.14 
 
 
538 aa  386  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  46.99 
 
 
529 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  48.72 
 
 
507 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  49.42 
 
 
548 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  44.03 
 
 
533 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  49.42 
 
 
548 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  49.04 
 
 
535 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  40.51 
 
 
532 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  51.78 
 
 
557 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  49.15 
 
 
519 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  49.53 
 
 
514 aa  376  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  40.39 
 
 
534 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 
541 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  42.41 
 
 
542 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  45.4 
 
 
522 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 
556 aa  362  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  39.38 
 
 
538 aa  355  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  46.88 
 
 
527 aa  353  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  43.97 
 
 
502 aa  353  8e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  44.02 
 
 
535 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  42.25 
 
 
533 aa  351  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  43.89 
 
 
515 aa  351  3e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  44.13 
 
 
535 aa  351  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  40.14 
 
 
565 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  41.68 
 
 
531 aa  350  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 
535 aa  350  8e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  42.24 
 
 
528 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  45.21 
 
 
538 aa  346  8e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  39.77 
 
 
535 aa  346  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  42.75 
 
 
515 aa  344  5e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 
534 aa  342  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  47.79 
 
 
509 aa  341  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
545 aa  340  5.9999999999999996e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  47.67 
 
 
509 aa  340  8e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 
532 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  41.38 
 
 
546 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  48.91 
 
 
509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  42.24 
 
 
550 aa  337  5.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 
509 aa  336  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  40 
 
 
531 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  40.83 
 
 
537 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  40.83 
 
 
537 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 
509 aa  335  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  40.83 
 
 
537 aa  335  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 
609 aa  334  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 
533 aa  334  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  39.89 
 
 
537 aa  334  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  41.44 
 
 
531 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  39.84 
 
 
509 aa  333  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  39.64 
 
 
509 aa  333  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  40.64 
 
 
537 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 
509 aa  333  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  40.64 
 
 
537 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 
509 aa  333  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  38.85 
 
 
555 aa  333  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  39.45 
 
 
519 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  40.64 
 
 
537 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  40.64 
 
 
537 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 
537 aa  332  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  40.72 
 
 
537 aa  332  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  40.49 
 
 
537 aa  331  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  44.1 
 
 
543 aa  332  3e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  42.3 
 
 
532 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 
533 aa  331  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.02 
 
 
531 aa  331  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 
534 aa  331  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  38.9 
 
 
509 aa  330  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  39.85 
 
 
579 aa  330  7e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  43.93 
 
 
534 aa  330  8e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  38.9 
 
 
509 aa  330  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  41.78 
 
 
533 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 
536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  40.36 
 
 
571 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  38.58 
 
 
543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  40.49 
 
 
550 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  45.61 
 
 
516 aa  328  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 
536 aa  327  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
540 aa  326  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
540 aa  326  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
540 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  39.14 
 
 
561 aa  326  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>