More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2871 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  96.86 
 
 		 509 aa  922    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  88.61 
 
 		 509 aa  806    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 509 aa  976    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  65.59 
 
 		 499 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  68.81 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  66.8 
 
 		 500 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  52.32 
 
 		 534 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  51.93 
 
 		 516 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  52.97 
 
 		 540 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  51.7 
 
 		 537 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  49.12 
 
 		 532 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  52.55 
 
 		 539 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  53.07 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  52.87 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  52.1 
 
 		 538 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  52.19 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  48.67 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  52.42 
 
 		 522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  52.11 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  50.64 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  51.45 
 
 		 518 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  48.16 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  52.98 
 
 		 502 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  51.48 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  52.16 
 
 		 513 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  51.21 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  48.18 
 
 		 531 aa  379  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  48.97 
 
 		 521 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  44.86 
 
 		 863 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 		 565 aa  333  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  45.06 
 
 		 867 aa  332  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  46.22 
 
 		 847 aa  332  9e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  41.18 
 
 		 541 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  46.34 
 
 		 545 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  47.52 
 
 		 872 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  45.58 
 
 		 598 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  47.91 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  51.55 
 
 		 501 aa  325  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  43.86 
 
 		 522 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  43.27 
 
 		 547 aa  322  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  37.9 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  37.25 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  45 
 
 		 532 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  43.92 
 
 		 575 aa  317  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  45.75 
 
 		 566 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2477  L-aspartate oxidase  46.6 
 
 		 503 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.2 
 
 		 542 aa  312  7.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  44.62 
 
 		 558 aa  312  7.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  37.68 
 
 		 538 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  40.5 
 
 		 515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 		 535 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  42.32 
 
 		 515 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  43.27 
 
 		 557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  45.67 
 
 		 548 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  38.84 
 
 		 571 aa  305  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  37.13 
 
 		 555 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.68 
 
 		 532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  38.69 
 
 		 509 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  40.64 
 
 		 556 aa  302  8.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  44.98 
 
 		 549 aa  302  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  38.04 
 
 		 516 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  38.25 
 
 		 509 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  38.25 
 
 		 509 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  38.93 
 
 		 519 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  38.34 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  38.1 
 
 		 509 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 		 550 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  39.66 
 
 		 534 aa  301  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  37.64 
 
 		 555 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  37.77 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  38.34 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 		 513 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 		 555 aa  299  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  37.65 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  40.94 
 
 		 529 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 		 533 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  40.69 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  38.75 
 
 		 556 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  35.6 
 
 		 528 aa  297  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 		 533 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  42.13 
 
 		 543 aa  296  6e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  40.85 
 
 		 535 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  36.35 
 
 		 566 aa  296  8e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  43.77 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  40.94 
 
 		 518 aa  294  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  40.27 
 
 		 535 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  40.47 
 
 		 535 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  36.81 
 
 		 531 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  38.28 
 
 		 538 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  38.28 
 
 		 538 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  44.31 
 
 		 572 aa  294  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  35.97 
 
 		 566 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 		 502 aa  294  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01131  L-aspartate oxidase  37.64 
 
 		 562 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01121  L-aspartate oxidase  36.86 
 
 		 555 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.517709  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  35.83 
 
 		 531 aa  292  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  36.49 
 
 		 531 aa  292  9e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2335  L-aspartate oxidase  40.46 
 
 		 552 aa  292  9e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  40.55 
 
 		 533 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>