More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2425 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 509 aa  1000    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  86.71 
 
 		 506 aa  828    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  65.12 
 
 		 522 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  66 
 
 		 506 aa  578  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  60.56 
 
 		 517 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  58.76 
 
 		 517 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  56.07 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  56.3 
 
 		 519 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  52.89 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  52.81 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  56.83 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  54.62 
 
 		 502 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  53.97 
 
 		 518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  48.48 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  50.4 
 
 		 534 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  52.26 
 
 		 539 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  53.35 
 
 		 509 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  50.91 
 
 		 540 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  48.89 
 
 		 537 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  51.58 
 
 		 538 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  50.96 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.6 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  51.19 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  52.31 
 
 		 500 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  51.62 
 
 		 532 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  53.63 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  46.97 
 
 		 531 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  47.51 
 
 		 545 aa  358  9e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  42.71 
 
 		 541 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  38.7 
 
 		 542 aa  349  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  43.43 
 
 		 515 aa  349  9e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  50.73 
 
 		 507 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  42.69 
 
 		 515 aa  346  6e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  45.96 
 
 		 863 aa  345  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  46.37 
 
 		 521 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  39.57 
 
 		 532 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  46.05 
 
 		 847 aa  341  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.36 
 
 		 535 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  38.89 
 
 		 519 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  45.95 
 
 		 566 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  44.62 
 
 		 867 aa  335  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  39.63 
 
 		 516 aa  334  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  37.83 
 
 		 525 aa  330  4e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  45.66 
 
 		 548 aa  329  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  38.46 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  42.86 
 
 		 543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  39.31 
 
 		 538 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  43.37 
 
 		 577 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  42.51 
 
 		 522 aa  325  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  39.96 
 
 		 565 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  37.58 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 		 598 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  36.9 
 
 		 509 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 		 575 aa  323  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  37.01 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  36.9 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  36.9 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  41.04 
 
 		 528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  41.05 
 
 		 529 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  40.71 
 
 		 533 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  40.68 
 
 		 556 aa  319  7e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  36.51 
 
 		 509 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  36.51 
 
 		 509 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  38.26 
 
 		 534 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  39.72 
 
 		 533 aa  316  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  43.09 
 
 		 507 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  38.21 
 
 		 531 aa  315  9e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  39.68 
 
 		 545 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  37.77 
 
 		 531 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  39.73 
 
 		 550 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  37.04 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  37.04 
 
 		 555 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  39.85 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  39.85 
 
 		 558 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  37.27 
 
 		 555 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  46.89 
 
 		 506 aa  311  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.68 
 
 		 532 aa  309  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 		 572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  38.95 
 
 		 556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  40.84 
 
 		 571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2375  L-aspartate oxidase  40.37 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01121  L-aspartate oxidase  38.37 
 
 		 555 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.517709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  40.77 
 
 		 557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  44.29 
 
 		 532 aa  306  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4515  L-aspartate oxidase  37.23 
 
 		 509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2477  L-aspartate oxidase  43.67 
 
 		 503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  37.99 
 
 		 531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 547 aa  303  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  45.94 
 
 		 872 aa  302  9e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  37.2 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  36.9 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  37.48 
 
 		 531 aa  300  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  38.51 
 
 		 531 aa  300  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  38.48 
 
 		 513 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  41.88 
 
 		 538 aa  300  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  44.75 
 
 		 556 aa  299  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  36.71 
 
 		 566 aa  299  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  43.55 
 
 		 502 aa  299  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>