More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1246 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  81.94 
 
 		 540 aa  806    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  77.97 
 
 		 534 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  83.2 
 
 		 539 aa  810    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 538 aa  1056    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  61.51 
 
 		 532 aa  618  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  61.35 
 
 		 537 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  62.23 
 
 		 532 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  57.76 
 
 		 532 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  53.97 
 
 		 531 aa  474  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  53.59 
 
 		 521 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  52.47 
 
 		 509 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  54.08 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  53.05 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  51.58 
 
 		 506 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  48.99 
 
 		 516 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  48.39 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  51.58 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  52.09 
 
 		 506 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  50.1 
 
 		 519 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  50.7 
 
 		 517 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  52.55 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  49 
 
 		 522 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  48.21 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.98 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  47.55 
 
 		 517 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  41.26 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40 
 
 		 535 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  48.36 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  52.07 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  50.29 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  45.33 
 
 		 518 aa  362  6e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  40.35 
 
 		 542 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  50.41 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  53.82 
 
 		 507 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  39.13 
 
 		 538 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  45.83 
 
 		 867 aa  352  8e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  46.82 
 
 		 547 aa  352  8.999999999999999e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  44.76 
 
 		 507 aa  349  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  43.95 
 
 		 545 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  43.6 
 
 		 522 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  41.88 
 
 		 541 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  44.66 
 
 		 847 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  42.4 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  41.71 
 
 		 863 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  39.58 
 
 		 532 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  45.86 
 
 		 548 aa  344  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  41.83 
 
 		 577 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  37.9 
 
 		 534 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  43.52 
 
 		 533 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  43.33 
 
 		 533 aa  339  8e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 		 528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  39.17 
 
 		 533 aa  335  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  43.56 
 
 		 572 aa  333  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  41.76 
 
 		 538 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  41.76 
 
 		 538 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  40.51 
 
 		 515 aa  333  6e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  39.11 
 
 		 531 aa  332  9e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  41.1 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  38.83 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  40.75 
 
 		 533 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  38.67 
 
 		 531 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  42.58 
 
 		 532 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  42.44 
 
 		 552 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  45.1 
 
 		 558 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  43.03 
 
 		 575 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 545 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  42.13 
 
 		 557 aa  329  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 		 530 aa  329  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  37.79 
 
 		 531 aa  329  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  38.34 
 
 		 509 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  38.34 
 
 		 509 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 		 566 aa  329  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  38.02 
 
 		 519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  39.41 
 
 		 516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  42.55 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  37.21 
 
 		 531 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  40.68 
 
 		 528 aa  326  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  42.36 
 
 		 533 aa  326  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  41.43 
 
 		 539 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 		 552 aa  325  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  37.35 
 
 		 509 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  36.98 
 
 		 509 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  37.18 
 
 		 509 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  37.94 
 
 		 509 aa  324  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  40.94 
 
 		 532 aa  323  6e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  37.52 
 
 		 528 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  43.59 
 
 		 549 aa  323  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  37.75 
 
 		 509 aa  323  7e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 		 543 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  38.33 
 
 		 532 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  42.99 
 
 		 546 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  40.91 
 
 		 539 aa  321  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  39.66 
 
 		 525 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 		 535 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  41.09 
 
 		 532 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  41.05 
 
 		 532 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>