More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0296 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 506 aa  989    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  63.75 
 
 		 506 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  66 
 
 		 509 aa  598  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  65.18 
 
 		 522 aa  588  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  60.72 
 
 		 517 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  58.33 
 
 		 517 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  56.59 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  55.27 
 
 		 519 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  52.54 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  52.33 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  56.39 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  57.53 
 
 		 513 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  58.53 
 
 		 513 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  53.8 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  50.71 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  52.69 
 
 		 538 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  52.05 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  47.36 
 
 		 532 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  51.21 
 
 		 539 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  51.52 
 
 		 540 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  50.31 
 
 		 534 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  51.62 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  51.88 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  49.3 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  50.3 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  48.76 
 
 		 531 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  53.66 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  50.3 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  46.85 
 
 		 521 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  45.27 
 
 		 522 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  42.02 
 
 		 532 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  50.21 
 
 		 507 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  41.93 
 
 		 516 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 		 515 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  41.63 
 
 		 515 aa  342  9e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  43.26 
 
 		 528 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  38.85 
 
 		 519 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.43 
 
 		 542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  42.34 
 
 		 543 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  42.51 
 
 		 529 aa  336  5.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  39.68 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  39.49 
 
 		 541 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  44.95 
 
 		 545 aa  332  8e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  41.96 
 
 		 863 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  43.33 
 
 		 572 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  37.42 
 
 		 509 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  42.43 
 
 		 847 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  48.85 
 
 		 506 aa  322  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  37.73 
 
 		 538 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  37.43 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  39.88 
 
 		 513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  37.63 
 
 		 509 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  37.1 
 
 		 509 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  37.22 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  41.54 
 
 		 556 aa  319  7e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  36.95 
 
 		 509 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  36.95 
 
 		 509 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  37.01 
 
 		 509 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  43.23 
 
 		 575 aa  316  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  36.81 
 
 		 509 aa  316  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  39.05 
 
 		 534 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  40.91 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  43.53 
 
 		 502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  44.49 
 
 		 556 aa  313  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  42.35 
 
 		 598 aa  313  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  39.21 
 
 		 545 aa  312  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  42.09 
 
 		 557 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3145  L-aspartate oxidase  37.68 
 
 		 502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0480414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  40.95 
 
 		 533 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  42.28 
 
 		 532 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 		 570 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 		 570 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 		 570 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 		 570 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 		 570 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  41.97 
 
 		 867 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 		 533 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  38.62 
 
 		 565 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  37.23 
 
 		 531 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 		 533 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  43.25 
 
 		 572 aa  306  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 		 523 aa  306  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  41.7 
 
 		 538 aa  306  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  38.09 
 
 		 571 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  37.67 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  43.83 
 
 		 548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  40.24 
 
 		 528 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  43.57 
 
 		 558 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4515  L-aspartate oxidase  37.22 
 
 		 509 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  40.24 
 
 		 532 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 		 528 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 		 528 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  38.98 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  38.98 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  40.16 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  37.6 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  40.71 
 
 		 533 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  40.41 
 
 		 507 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>