More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2216 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 516 aa  1011    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  63.78 
 
 		 519 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  58.89 
 
 		 512 aa  570  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  58.7 
 
 		 512 aa  554  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  58.3 
 
 		 517 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  54.76 
 
 		 517 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  56.62 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  55.53 
 
 		 522 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  58.95 
 
 		 502 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  56.07 
 
 		 509 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  56.24 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  55.6 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.34 
 
 		 499 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  48.63 
 
 		 537 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  52.12 
 
 		 540 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  51.53 
 
 		 518 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  51.93 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  49.5 
 
 		 534 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  51.93 
 
 		 509 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  55.74 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  50.67 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  50.1 
 
 		 539 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  52.24 
 
 		 532 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  46.56 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  48.99 
 
 		 538 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  44.25 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  52.1 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  50.86 
 
 		 501 aa  362  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  46.89 
 
 		 521 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  53.5 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  44.18 
 
 		 541 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  46.62 
 
 		 566 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  45.27 
 
 		 545 aa  339  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  39.57 
 
 		 532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  46.78 
 
 		 847 aa  336  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  46.08 
 
 		 572 aa  336  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  42.6 
 
 		 515 aa  334  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  43.88 
 
 		 863 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  43.45 
 
 		 529 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  50 
 
 		 506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.72 
 
 		 542 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  41.85 
 
 		 528 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  44.42 
 
 		 558 aa  326  6e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40 
 
 		 535 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  41.68 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  42.23 
 
 		 543 aa  325  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  43.49 
 
 		 575 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 507 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 		 565 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  38.06 
 
 		 538 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.9 
 
 		 532 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  43.38 
 
 		 867 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  46.31 
 
 		 572 aa  316  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  42.29 
 
 		 557 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  37.68 
 
 		 519 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  40.99 
 
 		 516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  44.65 
 
 		 538 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  40.28 
 
 		 545 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  43.78 
 
 		 532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  45.77 
 
 		 548 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  38.15 
 
 		 531 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  41.81 
 
 		 547 aa  307  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 		 533 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  42.25 
 
 		 577 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  50 
 
 		 549 aa  306  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  45.33 
 
 		 872 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 		 550 aa  304  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  44.55 
 
 		 502 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.29 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  39.63 
 
 		 556 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  50.39 
 
 		 527 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  38.09 
 
 		 534 aa  301  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 		 533 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  36.29 
 
 		 509 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  38.06 
 
 		 531 aa  299  6e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  36.03 
 
 		 509 aa  299  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  37.72 
 
 		 531 aa  299  8e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  40.28 
 
 		 513 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  36.03 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  36.03 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  36.23 
 
 		 509 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  41.01 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  36.16 
 
 		 509 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  36.16 
 
 		 509 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  36.23 
 
 		 509 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  36.85 
 
 		 566 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  39.43 
 
 		 533 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  38.04 
 
 		 533 aa  296  8e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  37.07 
 
 		 531 aa  295  9e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  34.96 
 
 		 525 aa  295  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  38.94 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2335  L-aspartate oxidase  42.31 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  36.97 
 
 		 531 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  39.39 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  40.18 
 
 		 566 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  40.09 
 
 		 555 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  40.31 
 
 		 555 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  37.04 
 
 		 532 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>