More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1468 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  58.66 
 
 
555 aa  668    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  97.35 
 
 
566 aa  1114    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  100 
 
 
566 aa  1170    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  58.3 
 
 
555 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  58.12 
 
 
555 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01131  L-aspartate oxidase  66.18 
 
 
562 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  61.83 
 
 
556 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0355  L-aspartate oxidase  61.06 
 
 
553 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2335  L-aspartate oxidase  60.61 
 
 
552 aa  621  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01121  L-aspartate oxidase  58.24 
 
 
555 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.517709  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  45.66 
 
 
550 aa  462  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  44.1 
 
 
565 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2375  L-aspartate oxidase  45.88 
 
 
559 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  43.17 
 
 
571 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  43.67 
 
 
558 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  43.67 
 
 
557 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  43.96 
 
 
609 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  43.2 
 
 
556 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2374  L-aspartate oxidase  44.28 
 
 
558 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  39.22 
 
 
515 aa  360  6e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 
507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  39.29 
 
 
532 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  37.06 
 
 
542 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  38.59 
 
 
515 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.1 
 
 
532 aa  346  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  38.42 
 
 
541 aa  346  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  39.05 
 
 
529 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  38.49 
 
 
534 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  37.89 
 
 
528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  37.24 
 
 
537 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  37.67 
 
 
533 aa  333  7.000000000000001e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  37.52 
 
 
546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  38.01 
 
 
533 aa  327  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  37.92 
 
 
528 aa  326  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  38.38 
 
 
534 aa  326  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  38.49 
 
 
523 aa  326  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  38.13 
 
 
542 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  36.77 
 
 
543 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  37.43 
 
 
538 aa  323  6e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  37.43 
 
 
538 aa  323  6e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  38.33 
 
 
541 aa  323  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  36.87 
 
 
535 aa  323  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  37.15 
 
 
532 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  37.15 
 
 
533 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  36.97 
 
 
533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  37.6 
 
 
522 aa  320  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  37.14 
 
 
536 aa  320  6e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  37.14 
 
 
536 aa  320  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  35.93 
 
 
533 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  37.15 
 
 
538 aa  319  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  35.88 
 
 
561 aa  319  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  37.01 
 
 
532 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  37.31 
 
 
532 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  36.75 
 
 
555 aa  316  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  37.2 
 
 
537 aa  316  9e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  35.5 
 
 
539 aa  316  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  35.58 
 
 
533 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  35.99 
 
 
525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  37.55 
 
 
556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  36.25 
 
 
538 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  36.38 
 
 
535 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  34.77 
 
 
531 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  36.82 
 
 
532 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  36.18 
 
 
531 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  35.75 
 
 
538 aa  313  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  35.81 
 
 
538 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  36.62 
 
 
525 aa  313  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  36.25 
 
 
538 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  35.94 
 
 
538 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  37.5 
 
 
537 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  37.32 
 
 
537 aa  312  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  35.81 
 
 
538 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  37.38 
 
 
537 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  37.38 
 
 
537 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  37.38 
 
 
537 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  37.38 
 
 
537 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  37.36 
 
 
525 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  37.08 
 
 
533 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  37.32 
 
 
537 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  39.52 
 
 
538 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  36.82 
 
 
538 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  35.82 
 
 
531 aa  310  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  35.22 
 
 
542 aa  310  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  34.58 
 
 
531 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  35.47 
 
 
531 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  37.35 
 
 
577 aa  309  9e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  36.85 
 
 
533 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  36.6 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  37.34 
 
 
529 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  36.33 
 
 
534 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2849  L-aspartate oxidase  34.35 
 
 
535 aa  308  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  36.26 
 
 
534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  36.85 
 
 
535 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  36.18 
 
 
534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  36.85 
 
 
533 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  37.97 
 
 
529 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  36.5 
 
 
534 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  36.47 
 
 
539 aa  306  8.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  36.98 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  35.26 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>